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第10章知核酸生物合成
第10章 核酸的生物合成 ? 中心法则(central dogma) DNA RNA 蛋白质 几个基本概念: 第1节 DNA的生物合成 三个方面: 1.复制 2.损伤修复 3.逆转录 三种大肠杆菌DNA聚合酶 1. DNA聚合酶I 3′ 5′外切酶; 5′ 3′聚合酶 5′ 3′外切酶 作用:切除引物、填补空缺、损伤修复 2. DNA聚合酶Ⅱ 3′ 5′外切酶 5′ 3′聚合酶 作用:DNA损伤修复 3. DNA聚合酶III 大肠杆菌DNA复制的主要酶 (二)引物酶和引发体 所有DNA聚合酶都只能在模板链的指令下,在引物(通常RNA)3’-OH添加新核苷酸功能,没有从头合成活力; 引物酶合成一小段RNA,作为DNA合成的引物; 必须与几种辅助蛋白组装成引发体,才有合成引物的活性。 如:DonaB、DonaC、DonaT、PriA、PriB、PriC等 (三)DNA连接酶(DNA ligase) 3’,5’ 磷酸二酯键的形成 哺乳动物:ATP供能, 大肠杆菌:NAD供能, 都需要Mg2+ 在DNA复制、重组及损伤修复中起作用 催化二段DNA链之间3’,5’ 磷酸二酯键的形成 (四)解螺旋酶 催化DNA双螺旋解链; 需ATP供能。 (五)单链结合蛋白(SSB) 与解开的单链结合,防止形成双螺旋; 防止核酸酶的降解; (六)拓扑异构酶 二、DNA的复制 半保留复制方式 DNA复制合成的子代DNA分子中,一条来自亲代DNA分子,另一条是新合成的,所以称为半保留复制。 二、DNA的复制过程 (2)模板DNA解除高级结构 解螺旋酶把双螺旋解开成单链,SSB立即结合单链。拓扑异构酶解开复制叉前方的超缠现象。 (3)RNA引物的形成 由引发酶以单链DNA为模板,按5’→3’合成引物。 原核生物 双向复制 (θ型复制) 特定起始点:oriC 真核生物 多个复制单位(复制泡) (复制起始点+复制叉) 多个起始点 DNA的起点和方式 原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。 真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个复制子(replicon) 。复制子是独立完成复制的功能单位。 在RNA引物上,由DNA聚合酶Ⅲ催化,在引物3’-OH每掺入一个核苷酸,从底物dNTP切下一个焦磷酸。 体内仅存在5’ → 3’的DNA聚合酶 去除RNA引物 补充空缺 连接 DNA聚合酶Ⅰ的小片段 5’ 3’外切酶 DNA聚合酶Ⅰ的大片段 3’ 5’外切酶 5’ 3’聚合酶 DNA连接酶 严格的碱基配对规律 聚合酶的选择作用 复制时有即时的校读功能 3’ 5’外切酶功能 DNA损伤的修复 四、逆转录作用 以RNA为模板合成DNA的过程。 逆转录酶(依赖于RNA的DNA聚合酶)。 逆转录酶性质 自发因素 物理因素 化学因素 紫外线损伤 电离辐射损伤(X线/?线) 亚硝酸盐 C U 5-溴尿嘧啶 5-BU A 氮芥类 烷化剂 羟胺 C- A 2. DNA损伤修复 光修复 切除修复 重组修复 3、DNA突变 第2节 RNA的生物合成 基因转录:以DNA为模板的RNA聚合酶的催化下,按照碱基配对原则,以四种NTP为原料,合成一条与DNA互补的RNA链的过程。 不对称转录:DNA双链中一条链的某一区段作为模板合成RNA,而另一条链不用于合成RNA。 转录起始于DNA模板的一个特定位点(启动子),并在一定位点终止(终止子),这个转录区域称为转录单位。 在转录中,双股DNA中只有一条链是模板(模板链)(反意义链) (-链) 另一条链为(编码链)(有意义链) (+链) 一、催化RNA合成的酶 1. 大肠杆菌RNA聚合酶 全酶= α2ββ’ σ 核心酶= α2ββ’ σ—识别转录起始信号。 β’—参与酶与底物的结合,以及与σ因子和核心 酶的结合。 β —参与σ因子和核心酶的结合,并参与RNA合成的引发、延伸。 α —与模板的结合、酶的滑动以及碱基识别有关。 大肠杆菌RNA聚合酶的结构示意图 2. 真核细胞RNA聚合酶 在DEAE-Sephadex柱上的洗脱次序称为酶Ⅰ、II、 Ⅲ
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