缢蛏EGFR基因内含子1内SNP位点多态性与生长性状相关性.PDFVIP

第43 卷 第 2 期 水 产 学 报 Vol. 43, No. 2 2019 年 2 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Feb., 2019 文章编号: 1000-0615(2019)02-0483-09 DOI: 10.11964/jfc.20171111053 缢蛏EGFR基因内含子1内SNP位点多态性与 生长性状相关性 1 1 1 1 1,2* 1,2,3 卫侃韵 ， 谢淑媚 ， 王沈同 ， 陈宇宽， 牛东红 ， 李家乐 (1. 上海海洋大学，水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室，上海 201306 ； 2. 上海海洋大学，水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心，上海 201306 ； 3. 上海海洋大学，上海水产养殖工程技术研究中心，上海 201306) 摘要：为研究缢蛏表皮生长因子受体基因(epidermal growth factor receptor ，EGFR)单核苷 酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 与生长性状(壳长、壳宽、壳高和体质量) 的 相关性。本实验利用直接测序法从缢蛏EGFR 基因的第一个内含子序列中共筛选到17个 SNP位点。卡方检验结果显示，在17个位点中，有13个位点符合Hardy-Weinberg平衡，位 点多态性检测显示17个位点中有10个位点表现为中等多态性(0.25PIC0.5) 。利用一般线 性模型(general linear model ，GLM)及多重比较对缢蛏EGFR基因中17个SNPs的多态性与生 长性状(壳长、壳宽、壳高和体质量)进行相关性分析，结果显示，16个SNP位点均与缢 蛏的壳长、壳宽、壳高及体质量呈显著性相关。由此可见，EGFR 基因可作为缢蛏生长 性状改良的候选辅助分子标记，并且为进一步研究其生长相关功能奠定基础。 关键词: 缢蛏；EGFR ；多态性；生长性状 中图分类号: Q 785 ；S 968.3 文献标志码: A [9] [10] [11] 缢蛏(Sinonovacula constricta)俗称蛏子，属 基因参与了细胞增殖 、创伤修复 、性腺发育 软体动物门(Mollusca)、瓣鳃纲(Lamellibranchia)、 等过程；对于序列中SNP位点的研究比较多，主 帘蛤目(Veneroida) 、竹蛏科(Solenidae) 、缢蛏属 要针对第一个内含子序列与癌症患者的关联性 [1] [12- 13] [12] (Sinonovacula) ，是我国双壳经济贝类之一 。近 分析 。Jou等 分析了不吸烟肺腺