蛋白质固液界面吸附的分子模拟生物化工专业论文.docxVIP

中文摘要蛋白质的界面吸附是一类基本的现象，也是解决界面科学、生命科学及工程 中文摘要 蛋白质的界面吸附是一类基本的现象，也是解决界面科学、生命科学及工程 技术领域中许多问题的关键，对蛋白质界面吸附问题的研究有着重要的理论和实 际意义。由于蛋白质同界面间相互作用的复杂性使得单纯依靠实验方法无法得到 吸附的完整信息。利用分子模拟方法，从微观水平上对蛋白质界面吸附进行研究， 有助于深入地了解蛋白质界面吸附的机理。本论文采用CHARMM22力场和 TIP3P水分子模型，在Ⅻ仃条件下，对聚十赖氨酸分子在金属铂(P0、无机非 金属氧化锌(ZnO)及有机高分子聚乙烯(PE)界面上的吸附过程分别进行了分 子模拟(MD)。考察了不同界面性质、水溶液、力场参数等因素对吸附的影响。 对聚十赖氨酸分子的构象变化、能量及运动等特性进行了分析，对蛋白质分子的 固液界面吸附机理进行了探讨。 模拟结果表明，在不同性质的界面上，经过吸附后，聚十赖氨酸分子主链构 象发生了变化，分子的毋螺旋结构有不同程度的减少。PE界面上的吸附作用强 于Pt及ZnO界面，更易使聚十赖氨酸分子发生变性。在晶格结构界面上，界 面原子排列密度越大对聚十赖氨酸分子的作用越强：界面原子排布规则的晶体界 面对聚十赖氨酸分子构象的影响较无规则界面强。固体界面的组成性质及界面形 态对蛋白质的吸附起到重要的影响作用。 对具有不同范德华参数和电荷的Pt界面上的聚十赖氨酸吸附体系进行的 MD计算表明，范德华作用和静电作用在吸附中均对聚十赖氨酸分子构象产生影 响，相对而言，静电力的作用影响更为显著，在吸附过程中起主导作用。 吸附过程中，水溶液在界面和聚十赖氨酸分子之间起到了重要的过渡媒介作 用，聚十赖氨酸同界面的相互作用是聚十赖氨酸分子、固体界面及水溶液之间共 同相互作用的结果，因此，界面的亲疏水性在蛋白质吸附中起着非常重要的作用。 采用分子模拟方法获得的结果，可以为蛋白质界面吸附的机理研究提供理论 基础，对相关领域技术的发展起到促进作用。 关键词：分子动力学模拟(MD)，聚十赖氨酸，铂(Pt)，氧化锌(ZnO)，聚乙烯 (PE)，吸附，构象变化 AB AB STRACT Protein adsorption on interface is a colnmon phenomena and a key to settle problems of surface science、biological science and engineering systems which is of great fundamental and practical importance．The complexity interaction between protein and surface make it impossible to get complete adsorption information only using experiment method．It is helpful to grasp protein adsorption mechanism using molecular simulation at the molecular level research．／n this work,we focus on poly-ten—lysine interactions with several interfaces by MD techniques in which protein is modeled with the CHARMM22 parameter set，water molecules are described by the transferable intermolecular potentials with three·site point charge model(TIP3P)，under NVT condition and the surfaces were platinum(Pt)，znie oxide (ZnO)and polyethylene(PE)．The influences of properties studied include the interface properties(interface structural and electrostriction nature)，dynamic behavior of aqueous and different force field factors’influence during adsorption．Analyze the conformation，energy and motion of poly-ten-l