基于线粒体COⅠ基因的中国近海棱鳀属鱼类DNA条形码.PDFVIP

第 40 卷 第 10 期 水 产 学 报 Vol. 40, No. 10 2016 年 10 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Oct., 2016 文章编号: 1000–0615(2016)10–1513–08 DOI: 10.11964/jfc.20151010101 基于线粒体CO Ⅰ基因的中国近海棱鳀属鱼类DNA条形码 * 宫亚运， 章 群 ， 曹 艳， 吕金磊， 杨喜书 (暨南大学水生生物研究中心，热带亚热带水生态工程教育部工程研究中心，广东 广州 510632) 摘要：为明确中国大陆近海棱鳀属鱼类的分类地位，采用国际通用的CO Ⅰ基因5端652 bp 序列作为DNA条形码，对中国近海棱鳀属全部6种鱼类62尾标本进行鉴定分析。结果 发现，所分析样品的序列碱基组成为T ：29.0% ，C ：26.3% ，A ：25.3% ，G ：19.4% ， A+T含量(54.3%)高于G+C含量(45.7%) ，转换/ 颠换率为3.76 。6种棱鳀属鱼类组成5个自展 支持率为100%的分支，除黄吻棱鳀和中颌棱鳀各为单系但聚合为一支外，其余4种均独 立成支；分支内与分支间平均遗传距离分别为0.2%(0.0%~0.4%)和17.7%(15.7%~19.0%)。 赤鼻棱鳀、汉氏棱鳀、杜氏棱鳀和长颌棱鳀均符合H e b e r t 提出的种间遗传距离 (15.7%~18.6%)大于或等于10倍种内遗传距离(0.0%~0.3%) 的标准，确定了它们的物种有效 性。黄吻棱鳀和中颌棱鳀的种内遗传距离皆为0.1% ，与其他4种棱鳀的种内遗传距离处 于同一水平；但二者种间遗传距离仅为0.6% ，明显低于其他物种间的种间遗传距离，属 于一般物种的种内遗传距离范围，表明二者亲缘关系很近；由于外部形态存在一定的差 异，且在分子系统树上各为单系，二者可作为同一物种的2个不同亚种处理，但也不排 除是2个近期分化形成物种的可能，在资源管理上应作为2个不同的进化显著单位分别加 以管理。 关键词: 棱鳀属；DNA条形码；CO Ⅰ基因；中国大陆近海 中图分类号: Q 785 ；S 917.4 文献标志码: A 棱鲦属(Thryssa)隶属辐鳍鱼纲(Actinopterygii) ， 准确的物种鉴定是开展生理生态研究和资 鲱形目(Clupeiformes) ，鲦科(Engraulidae) ，广泛 源开发利用的前提与基础。传统的鱼类分类主 [1] 分布于大西洋、太平洋和印度洋 ，是世界海洋 要依据物种的外部形态特征，并结合比较解剖 渔业的主要对象之一，具有重要经济价值；作 学特性和生态习性，虽能区分大部分鱼类，但 为温带和热带近海小型中上层低营养级饵料 过度依赖鉴定者的个人经验，很多鱼类的条纹、 [7] 鱼，在海洋生态系统能量流动与转换中起着承 斑点、体色等外部