葛根SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选.pdfVIP

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南方农业学报 Journal of Southern Agriculture 2018,49(1):1-7 1期 ·1· ISSN2095-1191;CODENNNXAAB DO :10.3969/j.issn.2095-1191.2018.01.01 葛根SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选 1 2 1 3 1 3 3* 尚小红,严华兵 ,曹 升 ,张尚文,谢向誉 ,王 艳 ,欧昆鹏 1 2 (广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁 530007 ;广西农业科学院 经济作物研究所,南宁 530007 ; 3 广西农业科学院 生物技术研究所,南宁 530007) 摘要:【目的】优化葛根SCoT-PCR反应体系,筛选适用于葛根的SCoT引物,为利用SCoT分子标记进行葛根种质 资源鉴定、遗传多样性分析及分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】采用正交设计对SCoT-PCR反应体系中的 DNA模板量、dNTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶量和引物浓度5个因素进行优化,利用最佳SCoT-PCR反应体系 筛选出适用于葛根的SCoT引物,并对该体系进行验证。【结果】最佳葛根SCoT-PCR反应体系20.00 µL :DNA模板 50.00 ng ,dNTPs 0.25 mmol/L ,Mg2+ 1.50 mmol/L ,引物 0.80 μmol/L ,Taq DNA 聚合酶0.50 U 。利用该体系从36条 SCoT引物中筛选出35条可从葛根中扩增出清晰条带的引物。使用3条引物对18个葛根材料进行PCR扩增,PCR产物 表现出良好的重复性、稳定性和丰富的多态性。【结论】建立的最佳葛根SCoT-PCR反应体系和筛选获得的35条SCoT 引物可适用于葛根种质资种鉴定、遗传多样性分析、相关分子标记开发等研究。 关键词:葛根;SCoT-PCR ;反应体系优化;引物筛选 中图分类号:S567.03 文献标志码:A 文章编号:2095-1191(2018 )01-0001-07 OptimizationofSCoT-PCRreactionsystemandprimer selectionforPuerariaDC. 1 2 1 3 SHANG Xiao-hong ,YAN Hua-bing ,CAO Sheng ,ZHANG Shang-wen , 1 3 3* XIE Xiang-yu ,WANG Yan ,OU Kun-peng 1 2 ( Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Key Lab ,Nanning 530007

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