含天冬氨酸残基肽链水解断裂机理的研究-应用化学专业论文.docxVIP

ⅢY ⅢY iiii■■I 肿8 舢8 俐3 肌7 ㈣2忡3 Study on Hydrolysis Cleavage Mechanism of Peptide with Aspartic Acid Residue By Zhao Yong-ping Under the Supervision of Prof．Ai Hong-qi A Thesis Submitted to the University of Jinan In Partial Fulffilment of the Requirements For the Degree of Master of Science University of Jinan Jinan，Shandong，P．R．China May 25，2011 原创性声明 原创性声明 本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独 立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不 包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研 究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完 全意识到本声明的法律责任由本人承担。 论文作者签名： 趁自!垩 Et 期： 趁ff。三。2主 关于学位论文使用授权的声明 本人完全了解济南大学有关保留、使用学位论文的规定，同意 学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允 许论文被查阅和借鉴；本人授权济南大学可以将学位论文的全部或 部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复 制手段保存论文和汇编本学位论文。 论文作者签名：嫠盘生 导师签名： 济南大学硕士学位论文目 济南大学硕士学位论文 目 录 摘 要 。IU ABSTRACT V 第一章绪论 。1 1．1概述 1 1．2方法 6 1．2．1计算机制的选择 6 1．2．2计算方法的选择 9 第二章非极性脂肪族氨基酸的水解断裂 11 2．1气相中非极性脂肪族氨基酸的水解断裂 一12 2．1．1气相中非极性脂肪族氨基酸水解断裂的决速步骤分析 12 2．1．2气相中非极性脂肪族氨基酸环化后加水发生断裂的分析 15 2．2溶剂中非极性脂肪族短肽的水解断裂 16 2．2．1水溶剂溶剂对短肽水解断裂的影响 。 ．17 2．2．2乙醇溶剂溶剂对短肽水解断裂的影响 。18 2．3本章小结 19 第三章R基不带电荷氨基酸的水解断裂情况 ．21 3．1气相中R基不带电荷短肽的水解断裂 24 3．1．1气相中R基不带电荷短肽水解断裂的决速步骤分析 24 3．1．2气相中非极性氨基酸与R基不带电荷短肽决速步骤所需能量比较 25 3．1．3气相中R基不带电荷短肽环化后加水发生断裂的分析 26 3．2溶剂中R基不带电荷短肽的水解断裂 27 3．2．1水溶剂水R基不带电荷短肽水解断裂的影响 27 3．2．2乙醇溶剂水R基不带电荷短肽水解断裂的影响 28 3．3本章小结 ．29 第四章芳香族氨基酸肽链的水解断裂 31 4．1气相中含芳香族氨基酸残基短肽的水解断裂 33 4．1．1气相中含芳香族短肽水解断裂的决速步骤分析 33 4．1．2气相中含芳香族短肽环化后加水发生断裂的分析 34 4．1．3气相中DAL、DSDl和DFDl决速步骤所需能量比较 4．1．3气相中DAL、DSDl和DFDl决速步骤所需能量比较 ．35 4．2溶剂中含芳香族氨基酸残基短肽的水解断裂 35 4．2．1水溶剂水对含芳香族短肽水解断裂的影响 35 4．2．2乙醇溶剂水对含芳香族短肽水解断裂的影响 ．36 4．3本章小结 。37 第五章R基带正电荷氨基酸残基短肽的水解断裂 ．．39 5．1气相中R基带正电荷氨基酸残基短肽的水解断裂 40 5．1．1气相中R基带正电荷短肽水解断裂的决速步骤分析 40 5．1．2气相中R基带正电荷短肽环化后加水发生断裂的分析 41 5．2溶剂中R基带正电荷氨基酸残基短肽的水解断裂 42 5．2．1水溶剂对R基带正电荷短肽水解断裂的影响 ．42 5．2．1乙醇溶剂对R基带正电荷短肽水解断裂的影响 ．43 5．3本章小结 一43 第六章含天冬氨酸残基短肽氮末端的水解断裂 ．45 第七章结论及展望 ．47 参考文献 ．j 。j 49 致谢 ．57 附 录 。59 一、在校期间发表的学术论文 ．．59 二、在校期间参加的项目 59 Ⅱ 济南人学硕l：学位论文摘要 济南人学硕l：学位论文 摘要 本文在B3LYP／6．31+G*水平上模拟计算了十五种氨基酸与天冬氨酸组成短 肽的水解断裂的过程，共计算了68种短肽异构体，发现只有29种短肽异构体可 以发生水解断裂。对这些可发生水解断裂的短肽异构体中决速步骤(环化)活化 能最低的异构体，本文又用M06．2X方法进行了验证，并