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;分子生物学基础实验;实验要求;一、? 质粒DNA小量制备的实验原理;作为基因工程的载体必须具备下列条件;质粒(plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小在1-120kb之间,具有双链闭合环状结构的DNA分子,主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中。质粒具有自主复制和转录能力,能使子代细胞保持它们恒定的拷贝数,可表达它携带的遗传信息。它可独立游离在细胞质内,也可以整合到细菌染色体中,它离开宿主的细胞就不能存活,而它控制的许多生物学功能也是对宿主细胞的补偿。;质粒在细胞内复制的两种类型;分离质粒DNA的三个基本步骤:;质粒DNA的相对分子量一般在106-107范围内,如质粒pBR322的相对分子质量为2.8×106,质粒pUC19的相对分子质量为1.7×106。
在细胞内,共价闭环DNA(covalently closed circular DNA,简称cccDNA)常以超螺旋形式存在。如果两条链中有一条链发生一处或多处断裂??分子就能旋转而消除链的张力,这种松弛型的分子叫作开环DNA(open circular DNA,简称ocDNA)。在电泳时,同一质粒如以cccDNA形式存在,它比其开环和线状DNA的泳动速度快,因此在本实验中,自制质粒DNA在电泳凝胶中呈现3条区带。 ;二、实验目的与内容;三、实验材料和试剂;高压蒸汽灭菌锅;超净工作台;台式高速离心机;恒温摇床;恒温培养箱;试剂;LB培养基的配制;微量移液器(pipetman)的使用;; 微量移液器的构造;微量移液器的操作;微量移液器的操作;离心机的使用;电子天平的使用;微波炉的使用;四、操作步骤;(二) 从菌落中快速提取制备质粒DNA;2. 弃上清,加入150μL GET缓冲液,充分混匀,在室温下放置10min。
;3. 加入200μL新配制的0.2mol/L NaOH(内含1% SDS),加盖,颠倒2~3次,使之混匀,冰上放置4min,最多不能超过5min。
;4 加入150μL冰冷的乙酸钾溶液。加盖后,颠倒数次使之混匀,冰上放置15min。;5. 4℃,10000r/min,离心5min,上清液吸至另一干净的1.5mL Ep离心管中,如上清液浑浊则需重新离心一次。;6. 于上清液中加等体积酚/氯仿液,振荡混匀,4℃,12000r离心2min,小心吸取上清液,转移至另一1.5mL Ep管中,注意勿将两液相中间的白色蛋白薄层吸出。;7. 向上清液加入2倍体积无水乙醇,混匀,室温放置3min。用离心机于10000rpm离心5min。;8. 小心吸去上清液,将离心管倒置于一张纸巾上,以使所有液体流出。;9. 用0.5mL 70%乙醇洗涤沉淀一次,除尽乙醇,室温自然干燥,备用。;10. 用25uL含无DNA酶的胰RNA酶(20 ug/mL)的TE重新溶解DNA,贮存于-20℃备用,可长期保存。;五、注意事项;4.苯酚可以用于抽提纯化DNA,由于苯酚的氧化产物可以使核酸链发生断裂。所使用的苯酚在使用前必须经过重蒸,且都必须用0.1mol/LTris-HCl (pH7.6)进行平衡。所以取酚/氯仿/异戊醇时应取下层溶液,因为上层是Tris-HCl液隔绝空气层。
5.酚/氯仿/异戊醇抽提时,应充分混匀。经酚/氯仿/异戊醇抽提后,吸取上清液时注意不要把中间的白色层吸入,其中含有蛋白质等杂质。
6.有些质粒本身可能在某些菌种中稳定存在,但经过多次移接有可能造成质粒丢失。因此不要频繁转接,每次接种时应挑单菌落。;六、问题和思考;七、实验报告;八、实验考核
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