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- 2019-05-14 发布于上海
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万方数据
万方数据
Sheep chromosome 13 reproductive traits relating analysis of
QTL mapping
A Dissertation Submitted to
Shihezi University
In Fulfillment of the Requirements For the Degree of
Master of Agriculture
By
(Animal Genetic and Breeding)
Dissertation Supervisor:
June, 2014 Shihezi, xinjiang, China
石河
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研究生签名: 时间: 年 月 日
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本 课 题 由 国 际 科 技 合 作 项 目 ( 项 目 编 号 :
DF2007DFB30420)——《绵羊非繁殖季节产羔性状 的 QTL 定位及相关基因的分离》和国家自然科学基金 项目(项目编号:3160444)——《绵羊非繁殖季节产 羔性状的 QTL 定位》资助完成
摘 要
绵羊是人类较早驯化的家畜之一,但由于绵羊的一些特性,使得人们始终无 法对其进行真正的现代化高效养殖。QTL是影响数量性状的一个染色体片段,是 对某一数量性状有一定决定作用的单个基因或微效多基因簇。生长相关性状一般 被认为是由微效多基因控制的数量性状,由于繁殖性状和体重性状为数量性状, 可能受到微效基因控制,也有可能受到几对主效基因控制,加上环境效应的影响而 表现连续的变异。
本研究以来自于新疆生产建设兵团第九师 165 团的德国美利奴公羊(12 只) 与中国美利奴母羊(600 只)杂交,从 F1 代选出公羊 5 只与母羊 300 只进行杂 交, 共累计产生有性状记录的 F2 代 150 只为群体。体尺性状体高、体斜长、胸 宽、腰角宽、体重,繁殖性状初生重和产羔数。选取来自 13 号染色体上多态性 好,等位基因多的 10 个微卫星标记,对体尺性状和繁殖性状进行关联分析,并 且绘制了 13 号染色体遗传连锁图谱,对于性状差异显著进行了 QTL 定位。研究 内容和结果如下:
(1)以德国美利奴公羊为父本中国美利奴为母本,构建了 F2 代参考群体 150 只,并与亲代进行比较,其亲代与 F2 代在成年体重和羔羊初生重上有显著 差异。说明这两个性状在后代出现了分离,此群体可以用于连锁图谱的构建和 QTL 定位分析。并以 DNA 提取、PCR 和电泳技术为基础,对表型性状和基因型 的统计分析,本研究所选 10 个微卫星在实验群体中共发现有 50 个等位基因,平
均等位基因为 5 个,其中最多的是 SCYAMS、BL1071,为 7 个,最少的是 BMS1669,为 2 个。扩增的等位基因长度在 109~326bp 之间,本研究所得结果为: 10 个所选微卫星标记中有 9 个呈现高度多态性,1 个呈现中度多态性,为绵羊 13 号染色体遗传连锁图谱的构建和 QTL 定位提供了保障。
(2)繁殖性状和体尺性状表型值差异的 F 统计检验:在本试验所建参考家系 中,在绵羊第 13 号染色体的微卫星标记 TGLA6 和标记 BMC1222 之间检测到可 能存在绵羊繁殖性状中影响绵羊初生重的 QTL 位点,具体位置在 13 号染色体的 15.3cM 处,经 F 检验达到了显著水平(P0.05),距 BMC1222 约 4.8cM;在绵 羊第 13 号染色体的微卫星标记 MCMA2 和标记 MCM253 之间检测到可能存在 绵羊体尺性状中影响绵羊成年体重的 QTL 位点,具体位置在 13 号染色体的 74cM 处,经 F 检验达到了显著水平(P0.05),距 MCM253 约 3.5cM。
(3)利用 crimap2.4 连锁图谱构建的方法和 GRIDQTL 在线软件绘制了 13 号染色体的遗传连锁图谱并对初生重和成年体重进行了 QTL 定位。在绵羊 13 号 染色体上 15.3c
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