三亚和琼海普通野生稻群体遗传结构的研究-生物化学与分子生物学专业论文.docxVIP

三亚和琼海普通野生稻群体遗传结构的研究摘要 三亚和琼海普通野生稻群体遗传结构的研究 摘要 共有37个SSR标记被用于研究来自海南岛三亚和琼海两地区的 两大普通野生稻的群体遗传结构。在这37个SSR座位中共检测到了 107个等位基因。平均每一个SSR座位有3个等位基因。SSR座位在 三亚普通野生稻群体中的变异要高于在琼海普通野生稻群体中的变 异，其中，SSR座位三亚普通野生稻群体中的多态率为91．8919％，在 琼海群体中的多态率为81．081 1％；观察杂合性在三亚与琼海两群体 中的平均值分别为0．5651、0．4079，理论杂合性在三亚与琼海两群 体中的平均值分别为0。4449、0。2057，非偏性杂合。眭在三亚与琼海 两群体中的平均值分别为0．4661、0．2627。相对于Hardy-Wei nberg 平衡定律下的杂合度，三亚普通野生稻群体与琼海普通野生稻群体都 有蓿过多的杂合度，两者的固定指数F分别为-o．2124、一0．5527。三 亚和琼海两群体的远交率t分别为1．5394、3．2346，这表明两群体 没有近亲杂交的现象。两群体之间存在着中等程度的遗传差异， FsT：0．3909，从而也表明在这两个普通野生稻群体内存在着60．91，6的 遗传变异。经F一统计检验，两群体偏离Hardy-Wei nberg平衡定律， F．产一0．3578，并且富含杂合性，但是在两群体作为一个整体水平上则 是缺乏杂合性，F．T-O．1730。在对每个SSR座位基因型频率的观察值 与Hardy-Wei nberg平衡状态下的理论值进行了x 2检验，结果显示在 三亚普通野生稻群体中，15个SSR座位的基因型频率的观察值与 Hardy-We i nberg平衡状态下的理论值在d=0．05，0．01，0．001水平 上有显著差异，19个SSR座位的基因型频率的观察值与 Hardy-We i nberg平衡状态下的理论值相符合。在琼海普通野生稻群 体中，11个SSR座位的基因型频率的观察值与Hardy-We i nberg平衡 状态下的理论值在a=0．05，0．们，0．001有显著差异，17个SSR座 位的基因型频率的观察值与Hardy-Weinberg平衡状态下的理论值相 符合。根据F。可推算出两群体间存在者徽弱的基因流，Nm=O。3895， 即每一代两群体所交换的野生稻为0．3895株。根据Ne i的1 972年的 遗传距离公式得到三亚与琼海两普通野生稻群体间的遗传距离为 0．4486。通过计算三亚、琼海两地的野生稻及两种栽培稻、7份野生 稻之间的遗传距离以及运用UPGMA(Unweighted 稻之间的遗传距离以及运用UPGMA(Unweighted pai r—group method with arithmetic mean，算术平均非加权配组法)对这些材料进行聚 类分析时发现三亚、琼海两地的野生稻为偏籼型野生稻。 关键词普通野生稻基因频率基因型频率 THE THE STUDY 0F GENETIC STRUCTURE 0F POPULATION OF COMMON WⅡ。D RICE D．R“F曰’DGDⅣGRIFF．IN SANYA AND QIONGHAI ABSTRACT We studied the genetic structure of two populations of common wild rice O．rufipogon Griff from Sanya city and Qionghai city in Hainan using 37 SSR markers．107 alleles were detected in the 37 SSR loci．3 alleles for one locus on average．SSR5 have more genetic variability in Sanya population than in Qionghai population．ne percentage of SSR loci polymorphic is 91．8919％in Sanya population and 81．081l％in Qionghai population．The value of direct count heterozygosity iS 0．565 l in Sanya population，0．4079 in Qionghai population；the value of expect heterozygosity iS 0．4449 in Sanya population，0．2057 in Qionghai population；the value of un