real-time-pcr-标准曲线制作.docVIP

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荧光定量PCR之绝对定量分析——标准曲线的绘制 Time:2010-05-17 PM 21:15  Author:bioer  Hits:  1. \o 绝对定量专题 绝对定量定义 ??????? \o 绝对定量专题 绝对定量是用已知浓度的标准品绘制 \o 标准曲线专题 标准曲线来推算未知样品的量。 ??????? ?将标准品稀释至不同浓度,作为模板进行PCR反应。以标准品拷贝数的对数值为横坐标,以测得的CT值为纵坐标,绘制 \o 标准曲线专题 标准曲线,对未知样品进行定量时,根据未知样品的CT值,即可在 \o 标准曲线专题 标准曲线中得到样品的拷贝数。 *?Log(起始浓度)与循环数呈线性关系,通过已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,即得到该扩增反应存在的线性关系 *?由样品CT值,就可以计算出样品中所含的模板量 2. \o 绝对定量专题 绝对定量标准品 标准品的一些标准 *?必须用与扩增目的基因相同的引物进行扩增,并且扩增效率相同 *?标准品必须是经过准确定量的(我们通常用的是ASP-3700紫外光/可见光微量分光光度计) * 标准品必须是标准化的(例如,同一化的细胞数) * 在每组实验时,必须用相同的阈值设定来确定CT值 ????????标准品可以是含有目的基因的线性化的质粒DNA,也可以是比扩增片段长的纯化后的PCR产物,当然也可以是基因组DNA,甚至cDNA,但前提是所有的作为标准品的核酸都必须保证稳定。 3. 标准品的制备 ????? ??????? 一般一条标准曲线取四到五个点,浓度范围要能覆盖样品的浓度区间,以保证定量的准确性。一般一个点重复三至五次,对于常期稳定使用的标准品可以适当减少重复的次数。 倍比梯度稀释方法: 1v原液(标准品i)+9v稀释缓冲液,得标准品ii 1v标准品ii+9v稀释缓冲液,得标准品iii 1v标准品iii+9v稀释缓冲液,得标准品iv 1v标准品iv+9v稀释缓冲液,得标准品v 依次倍比稀释 拷贝数的计算:详见 核酸拷贝数的计算 4. 实例 标准品的制作:将标准品依次进行10倍稀释,ASP-3700 测得其拷贝数1.55×108copy /ul 标准曲线的绘制(1cycle=1min) 设置对照:浓度为1.55×107、1.55×106、1.55×105、1.55×104、1.55×103、1.55×102、1.55×101的标准样品各一个,设空白对照 PCR反应:以不同浓度标准品作为模板 ????????????????????????????????????????????????? 标准品的扩增曲线 ?? ???????????????????????????????????????????????? ?标准品的溶解曲线 ??????????????????????????????????????????????? ???????????????????????????????????????????????????标准品的标准曲线图 ?????? ?X? ?Log ?7? ?6?????? ?5?????? ?4???????? ?3 ?2 ?1 ?Y? ?CT值 ?12.01?? ?14.89 ?17.92???? ?21.18 ?24.56 ?27.89 ?31.25 ?????????? 扩增效率(E)计算 E=10-1/斜率=10-1/-3.23=2.04,E%=(2.04-1)×100%=104% ??????? 若未知样本的CT值为19.11,将CT值代入线性方程: 即19.11=34.29-3.23X,所以X=(19.11-34.29)/(-3.23)=4.7 Quantityunknow=104.7=50118 copies

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