谷子干旱表达谱与醛脱氢酶基因家族的鉴定.pdfVIP

摘要 摘要 谷子属于耐旱禾本科作物，大多是生长干旱与半干旱地区，同时属于C4作 物，基因组小，生长周期短等特点及在2011年谷子基因组测序结果的公布。这 些特点有利于利用谷子克隆优良的抗逆基因，研究植物的抗逆分子机制。然而， 对谷子进行系统的表达谱研究的报道较少。醛脱氢酶(ALDH)基因家族是～类 能编码NAD(P)+依赖的，能将内生与外生的醛类物质氧化成相应羧酸的酶。醛脱 氢酶(ALDH)基因家族在植物逆境环境中起着重要的作用。为此，本文采用 RNA．seq方法分析了谷子在干旱胁迫表达谱，测序结果经过分析发现测序结果中 很多醛脱氢酶基因家族，希望从中筛选优良的抗逆基因。实验结果如下： 1、通过谷子测定谷子干旱处理表达谱发现：有3777个基因上调，3316个 基因下调，大部分基因都被进行了GO注释与Pathway注释。 2、谷子ALDH基因家族鉴定与命名：谷子中鉴定出20个ALDH基因并根 分成10个家族。 3、ALDH基因在谷子染色体上分布与染色体共线性分析表明：谷子ALDH 基因家族的基因跟串联复制或整个基因组复制有关，说明串联复制和整个基因组 复制对谷子ALDH基因扩增起着重要作用。 4、谷子与水稻的共线性分析发现，大部分的ALDH基因位于两者的共线性 区域，表明谷子与水稻ALDH基因拥有同一祖先。水稻种的大部分基因功能都 已得到较好的诠释，故可根据水稻ALDH基因的研究来推测谷子中相应的同源 基因的功能。 5、谷子醛脱氢酶(ALDH)基因可能参与植物抗逆相关过程。实时定量结果 表明，大量ALDH基因在不同非生物胁迫条件下表达量增加，如：S认LDH2C．3、 SiALDH3H．1等。 6、谷子ALDH基因在大肠杆菌对盐胁迫表达分析表明，SiALDH2B．1，、 菌的耐盐性，这五个基因可能对植物的胁迫适应性中发挥着重要作用。 关键词：谷子；醛脱氢酶，共线性分析；RNA．seq；干旱；表达谱分析 万方数据 Abstract Abstract Foxtailmillet(SetariaitalicaL．)，anelite crop，grown drought—tolerantpoaceae a small inaridandsemi-arid isaC4 withcomparatively regions．it ponicoidcrop andshortlife andThe ofthefoxtailmillet genome cycle completion genome in2011．Thesetraitswerebeneficialtocloneexcellentstressresistance sequencing fromfoxtailmilletand the stress—tolerantmolecularmechanisms． gene studyplant offoxtailmillet to responseddrought However，systemstudy expressionprofiles stresswas a of