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实验六、 限制性片段长度多态性
(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)
一、实验目的
学习和掌握限制性片段长度多态性(RFLP)遗传标记的基本原理和检测方法。
二、实验原理
第一代分子遗传标记RFLP是根据不同品种(个体)基因组的限制性内切酶的酶切位点碱基发生突变,或酶切位点之间发生了碱基的插入、缺失、重排等,导致酶切片段大小发生了变化,这种变化可以通过PCR,酶切及琼脂糖凝胶电泳进行检测,从而可比较不同品种(个体)的DNA水平的差异(即多态性),RFLP已被广泛用于基因组遗传图谱构建、基因定位以及生物进化和分类、遗传多样性等研究。
三、仪器、材料与试剂
仪器: 电热恒温水浴锅,琼脂糖凝胶电泳及检测系统
材料与试剂:Hind Ⅲ 限制性内切酶,10×M Buffer,待分析的PCR产物,DL2000 DNA Marker,6×Loading Buffer(上样缓冲液),灭菌双蒸水,1.5%琼脂糖凝胶(注意:含溴化乙锭EB,致癌,请带手套操作),0.5%TBE(电泳缓冲液)。
四、实验步骤
1、Hind Ⅲ 限制性内切酶酶切
反应体积(10μl),在0.2ml Eppendorf管中依次加样:
10xM buffer 1 μL
ddH2O 5.5 μL
Hind Ⅲ 0.5 μL
PCR产物 3 μL
37℃水浴消化2h,消化产物全部用于琼脂糖检测
2、琼脂糖凝胶电泳
配置1.5%琼脂糖凝胶,取10μl 酶切产物+1μl 上样缓冲液,180V恒压电泳。DNA带负电荷,电泳时DNA从负极向正极泳动。待泳动至凝胶的1/2~2/3位置时,停止电泳,紫外检测仪下观察。
五、作业
写出本实验的具体操作过程并描述你所观察到的结果。(画图)
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
1000 100 2000 BB AA 750 500 AB
1000
100
2000
BB
AA
750
500
AB
250
Hind Ⅲ内切酶识别位点:A↓AGCTT
TTCGA↑A
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