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剪接选择不同的5’端和外显子 剪接选择不同的3′端和外显子 3) 可变剪接的调控机制 实质是5’供体与3’受体剪接点的选择搭配 如何选择不同的位点? SR蛋白家族:SF2剪接因子,与mRNA 结合,决定5’剪接位点 RNP的调节:hnRNP-A1, U5-snRNP 人类编码蛋白的基因约27000个,蛋白种类约90000。 40%~60%人类编码蛋白的基因发生可变剪接; 高等真核生物基因组很大,完全能容纳更多的基因。 为什么一方面它的许多基因非常分散,而另一方面它又使一个基因产生出多种产物? 4) 可变剪接的意义 令人不解 !? 1 rRNA和tRNA的加工:剪切和修饰 2 mRNA加工成熟: 1)mRNA前体的可变剪接 2)mRNA前体的反式剪接 3)RNA编辑 SP1 与GC盒结合的转录因子SP1中有连续的3个锌指重复结构。 表 带有Cis/His锌指结构的转录因子和DNA结合蛋白 蛋白 来源 大小 指 结合的DNA 靶 启动子 功能 TFⅢA 哺乳动物 37,000 9 50bp 5S基因 pol Ⅲ 5S基因转录因子 SP1 哺乳动物 105,000 3 10bp GC box pol II 一般的转录因子 ADR1 果蝇 150,000 2 22bp ADH2基因 pol II 激活ADH基因 Kruppel 果蝇 60,000 5 ? ? ? 胚的分化 B. Cys2/Cys2 Zn2+与4个Cys结合 共有序列:Cys- X2- Cys-X13- Cys- X2- Cys 无大量重复性锌指 表 Cys2/Cys2型的作用因子 蛋白 大小 指 靶 糖皮质激素受体 94,000 2 GRE中20bp 雌激素受体 66,000 2 ERE中20bp GAL4(酵母) 99,000 1 UAS中17bp 例如:甾类激素受体家族 糖皮质激素特异性 雌激素特异性 甾类激素受体以二聚体形式发挥其促进转录的作用。 两个锌指的功能不同: 与DNA结合 形成二聚体 (2) DNA结合域的结构花式/基元( motif) 锌指结构(Zinc finger ) 螺旋-转角-螺旋结构(helix-turn-helix,HTH) 同源异形结构域(Homeodomains,HD) 螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH) 亮氨酸“拉链” (leucine zipper ) ② 螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH) 至少有两个α螺旋,其间由短肽段形成的β转角连接, 二聚体形式存在, 距离正好相当于DNA一个螺距(3.4nm),两个α螺旋刚好分别嵌入DNA的深沟。 许多调控蛋白都有HTH LacO的阻抑蛋白 λ阻遏蛋白与cro蛋白λCAP 酵母接合型调控蛋白α1,α2 玉米的Kn1 水稻的OSH1 (2) DNA结合域的结构花式/基元( motif) 锌指结构(Zinc finger ) 螺旋-转角-螺旋结构(helix-turn-helix,HTH) 同源异形结构域(Homeodomains,HD) 螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH) 亮氨酸“拉链” (leucine zipper ) 编码60aa的序列,几乎存在于所有真核生物中; 有3个?-helix, H1与H2平行 H3位于大沟中,与DNA特异结合 N端多余臂部分与小沟结合,稳定性高。 ③同源异形结构域(Homeodomains,HD) HD与HTH的不同: (1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟; 而HTH至少2个α-螺旋构成; (2)HD以单体形式与DNA结合,靶序列不是回文结构, 而HTH以二聚体形式与DNA结合,靶序列是回文结构。 (2) DNA结合域的结构花式/基元( motif) 锌指结构(Zinc finger ) 螺旋-转角-螺旋结构(helix-turn-helix,HTH) 同源异形结构域(Homeodomains,HD) 螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH) 亮氨酸“拉链” (leucine zipper ) ④螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH) 40~50aa 含2个?-helix(15~16aa), 由连接区(12~28aa)连接; 两亲性;通过疏水面作用形成二聚体; -NH2端为DNA结合区,16aa,其中6aa为保守序列。 -COOH,每隔7个氨基酸出现一个Leu,所有Leu出现在同一侧面,成直线排列,形成疏水面
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