建鲤FABP3基因分离及其多态性与增重的相关分析.pdfVIP

第36 卷第 12 期 水 产 学 报 Vol.36, No.12 2012 年 12 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Dec., 2012 文章编号: 1000-0615(2012)12-1809-10 DOI:10.3724/SP.J.1231.2012.27971 建鲤 FABP3 基因分离及其多态性与增重的相关分析 * 俞菊华 , 李红霞, 李建林, 唐永凯, 夏正龙, 董在杰 ( 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心, 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081) 摘要 : 为获得与建鲤增重相关的分子标记进行建鲤分子育种, 实验在建鲤心肌型脂肪酸结合蛋 白(FABP)基因上筛选了与增重相关的 SNP 位点。首先使用 PCR 扩增到 2 个建鲤 FABP3 基因, jlFABP 3a 和3b 基因, 两个基因均有4 个外显子和3 个内含子组成, 3a 和3b 阅读框相似性为93%, 编码 133 个氨基酸, 相似性为94%, 内含子长度和序列存在着明显差异。jlFABP3 的系统进化和 传统的分类地位一致。通过序列比对,在3a 和3b 上分别找到26 和25 个SNP 位点。构建PCR-RFLP 法检测了其中3 个SNPs 在建鲤群体中的分布, 并与增重进行相关分析, 结果显示，C30G 与检测 群体雌、雄鱼鱼种阶段和雌鱼成鱼阶段增重显著相关(P0.05), CC 型个体增重显著快于CG 型个 体。G267T 在5 个家系中与雌鱼成鱼增重相关, 在7 个家系中不同基因型个体增重虽呈相同趋势 但差异不显著(P0.05) 。同时考虑G267T 和C30G 位点, 则发现GGCC 个体在雌、雄鱼增重均最 大, 在雌、雄鱼中分别比GGCG 个体快17%和12%。GGCC 个体在实验样本中占约9%, 存在着 较大的选育空间。 关键词: 建鲤; 心肌型胞内脂肪酸结合蛋白; 单核苷酸多态性; SNP-增重相关分析 中图分类号: Q 785; S 917.4 文献标志码: A 胞内脂肪酸结合蛋白(fatty acid binding pro- 洞内静电网络和蛋白稳定性[4] 。脊椎动物FABP 基 teins, FABPs)属于一个多基因家族, 分子量 14~15 因家族的基因结构由4 个外显子和3 个内含子组成, ku, 能结合脂肪酸和其它亲脂性物质如类花生四 尽管内含子的长度在不同成员间差异较大, 但内 烯酸和视黄醛, 参与疏水性长链脂肪酸的胞外和 含子的插入位点相同[3-4] 。由于FABPs 分子量较小, 胞内膜间转移[1], 也能作为分泌型蛋白调控细胞的 在人类疾病诊断中被用作组织损伤的标志物, 如 生长和增殖[2] 。在哺乳类, 胞内或者细胞质FABPs FABP3 已被用于心肌梗塞、心绞痛等诊断的标志 [5] 至少包含9 种截然不同的蛋白, 分别在不同的组织 物 。 表达, 如主要在肝脏、骨骼肌表达的L 型、在肠表 在FABP 家族中, FABP3 和FABP4 被认为具有 达的I 型、心脏和肌肉的H 型(FABP3)、还有脂肪 影响肌内脂肪(intramuscular