酶切位点保护性碱基的添加原则.docVIP

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PCR 设计引物时酶切位点的保护 切割率 % 酶 寡核苷酸序列 2 hr 20 hr Acc I G GTCGAC C CG GTCGAC CG CCG GTCGAC CGG 0 0 0 0 0 0 Afl III C ACATGT G CC ACATGT GG CCC ACATGT GGG 0 90 90 0 90 90 Asc I GGCGCGCC A GGCGCGCC T TT GGCGCGCC AA 90 90 90 90 90 90 Ava I C CCCGGG G CC CCCGGG GG TCC CCCGGG GGA 50 90 90 90 90 90 BamH I C GGATCC G CG GGATCC CG CGC GGATCC GCG 10 90 90 25 90 90 Bgl II C AGATCT G GA AGATCT TC GGA AGATCT TCC 0 75 25 0 90 90 BssH II G GCGCGC C AG GCGCGC CT TTG GCGCGC CAA 0 0 50 0 0 90 BstE II G GGT(A/TACCC 0 10 BstX I AACTGCAGAA CCAATGCATTGG AAAACTGCAG CCAATGCATTGG AA CTGCAGAA CCAATGCATTGG ATGCAT 0 25 25 0 50 90 Cla I C ATCGAT G G ATCGAT C CC ATCGAT GG CCC ATCGAT GGG 0 0 90 50 0 0 90 50 EcoR I G GAATTC C CG GAATTC CG CCG GAATTC CGG 90 90 90 90 90 90 Hae III GG GGCC CC AGC GGCC GCT TTGC GGCC GCAA 90 90 90 90 90 90 Hind III C AAGCTT G CC AAGCTT GG CCC AAGCTT GGG 0 0 10 0 0 75 Kpn I G GGTACC C GG GGTACC CC CGG GGTACC CCG 0 90 90 0 90 90 Mlu I G ACGCGT C CG ACGCGT CG 0 25 0 50 Nco I C CCATGG G CATG CCATGG CATG 0 50 0 75 Nde I C CATATG G CC CATATG GG CGC CATATG GCG GGGTTT CATATG AAACCC GGAATTC CATATG GAATTCC GGGAATTC CATATG GAATTCCC 0 0 0 0 75 75 0 0 0 0 90 90 Nhe I G GCTAGC C CG GCTAGC CG CTA GCTAGC TAG 0 10 10 0 25 50 Not I TT GCGGCCGC AA ATTT GCGGCCGC TTTA AAATAT GCGGCCGC TATAAA ATAAGAAT GCGGCCGC TAAACTAT AAGGAAAAAA GCGGCCGC AAAAGGAAAA 0 10 10 25 25 0 10 10 90 90 Nsi I TGC ATGCAT GCA CCA ATGCAT TGGTTCTGCAGTT 10 90 90 90 Pac I TTAATTAA G TTAATTAA C CC TTAATTAA GG 0 0 0 0 25 90 Pme I GTTTAAAC G GTTTAAAC C GG GTTTAAAC CC AGCTTT GTTTAAAC GGCGCGCCGG 0 0 0 75 0 25 50 90 Pst I G CTGCAG C TGCA CTGCAG TGCA AA CTGCAG AACCAATGCATTGG AAAA CTGCAG CCAATGCATTGGAA CTGCAG AACCAATGCATTGGATGCAT 0 10 90 90 0 0 10 90 90 0 Pvu I C CGATCG G AT CGATCG AT TCG CGATCG CGA 0 10 0 0 25 10 Sac I C GAGCTC G 10 10 Sac II G CCGCGG C TCC CCGCGG GGA 0 50 0 90 Sal I GTCGAC GTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GC GTCGAC GTCTTGGCCATAGCGGCCGCG G ACGC GTCGAC GTCGGCCATAGCGGCCGCG GAA 0 10 10 0 50 75 Sca I G AGTACT C AAA AGTACT

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