《分子遗传学》第6章转录后加工.ppt

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三. I类内含子的剪接 Cech等1981年用四膜虫分离得到了35S的前体rRNA,它含有一个长413bp的内含子。 此35S rRNA要加入一价或二价阳离子及GTP就可以在体外释放出413b的线性的内含子, 若继续保温,那么线形内含子又可形成环状的RNA。这就意味着35S RNA在GTP的作用下可以自我剪接。 (一)I类内含子的结构特点是 1. 其边界序列为5′U-G 3′; 2. 具有中部核心结构(Central core strucature) 3.内部引导顺序(internal guide seguence IGS) (二) I类内含子的剪切机制 转酯反应(transesterification): 酯键从一个位置转移到另一个位置。 四. Ⅱ类内含子的剪接 (一)结构特点 (1) 边界序列为5′↓GUGCG……YnAG↓; (2) 有6个茎环结构;有分支点顺序(branch-point seguence) (二)剪接机制 无需鸟苷的辅助,但需镁离子的存在。 分枝点A的2′-OH对5′端交界处的磷酸二酯键发动亲核进攻,产生了套索(lariat)结构(图13-31); 切下的外显子1其3′-OH继续对内含子3′端的交界序列进行亲核进攻,同时释放出套索状的内含子。 五. 核mRNA的剪接 (一) 结构特点: 1. 边界顺序:符合GU-AG法则。 2. 分枝点顺序:为Py80NPy87Pu75APy95其中A为百分之百的保守,且具有2′-OH。 3.内含子5′端有一保守序列可以和U1 snRNA的5′端的保守顺序互补 (二)剪接机制 剪接因子 snRNPs U1,U2,U5和 U4/U6。 第四节 编辑 编辑的发现 编辑(editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入,丢失或转换等现象。 1986.R.Benne在研究锥虫线粒体mRNA转录加工时发现m RNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸,1990年在高等动物和病毒中也发现了编辑现象。 编辑的生物学意义: (1)校正作用; (2)调控翻译; (3)扩充遗传信息。 编辑的调控作用 线虫coxII 基因的编辑 二.编辑的机制 1990年L.Simpsom等发现指导RNA(guide gRNA)。 第六章 转录后加工 转录后的加工(posttranscriptional modification) (1)减少部分片段:如切除5′端前导序列,3′端拖尾序列和中部的内含子; (2)增加部分片段:5′加帽,3′加poly(A),归巢和通过编辑加入一些碱基; (3)修饰:对某些碱基进行甲基化等。 第一节 tRNA和rRNA的加工 一. 原核的 tRNA和 rRNA的加工 参与蛋白质合成的tRNA和rRNA都不是最初的转录产物 (1) 它们的5′端都是单磷酸,而原始的转 录产物5′应是三磷酸; (2) 分子比初始转录物小; (3) tRNA含有特殊的碱基,这些碱基只有通过一些化学修饰才可以得到。 (一) tRNA的加工 tRNA的加工分成3个阶段 (1) “斩头”,形成5′末端; (2) 去尾,形成3′-OH末端。 (3)修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等进行修饰,如氨基酸臂的4-硫尿苷(4tu),D臂的2甲基鸟苷(2mG),TψC臂的假尿苷(ψ)和反密码子环上的2异戊腺苷(2ipA) (二) rRNA的加工 二 真核的tRNA和rRNA的加工 真核tRNA的基因和原核不同: (1)真核的前体分子tRNA是单顺反子,但成 簇排列,基因间有间隔区; (2)真核tRNA基因一般都比原核tRNA基因多 得多,如酵母约有400个tRNA基因; (3) 5′端单磷酸核苷酸,表明已被加工过; (4) tRNA的前体分子中含有内含子。 酵母tRNA的加工主要分成两个步骤: 切除内含子 连接外显子 真核tRNA内含子切除的特点: (1)没有交界序列,也没有内部引导序列; (2)剪切反应的信号是二级结构,而不是 一 级结构; (3)是依赖于蛋白质性的RNase,而不是核 糖拟酶或snRNP; (4)反应的本质不是转酯反应。 (1) 切除5′端的前导序列; (2) 从41S的中间产物中先切下18S的片段。 Hela细胞的切点在18S和5.8S之间的ITS(内部转录间隔序列); L细胞的切点在 18S序列和ITS的交界处,称为先成熟。 (3) 部分退火,形成发夹结构; (4) 最后修正。 真核细胞中rRNA的加工途径 第二节 前体mRNA的加工 mRNA前体分子的加工主要是真核mRNA,

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