2019年医学遗传学第六章多基因遗传病.ppt

遗传标志（ genetic markers ） ? 遗传标记必须满足的二点特性：多态性与位 置已知。 ? SNP: 大于 1% ， causative SNPs, functional SNPs 遗传标志（ genetic markers ） ? 遗传标记必须满足的二点特性：多态性与位 置已知。 ? SNP: 大于 1% ， causative SNPs, functional SNPs ? STR ： 微卫星标记，如 (XX) n ， (XXX) n ， (XXXX) n ； 其中最常用的为 (CA) n 。 recombination ? The formation of new combination of linked genes by crossing over (breakage and rejoining) between their loci. 遗传重组 重组值的计算 连锁（ linkage ） 位于同一条染色体上的基因或者遗传标 记，它们在减数分裂产生配子的时候，如果 倾向于把处在同样染色体上的等位基因共分 离到同一个配子中去，这时基因或遗传标记 之间的关系称为连锁。 问题：什么是紧密连锁？强连锁？不连锁？ Linkage Disequilibrium (LD) ? The preferential occurrence of a disease gene is associated with specific alleles of linked markers. ? LD is the non-random association between alleles at two loci. ? The extent of LD is typically measured by D. 连锁不平衡 单倍型（ haplotype ） 单倍型：同一条染色体上紧密相连的两个或两个以上多态 位点的状态的组合。 Phenotype Black eye GAT A TTCGTAC G GA - T Brown eye GAT G TTCGTAC T GA A T Black eye GAT A TTCGTAC G GA - T Blue eye GAT A TTCGTAC G GA A T Brown eye GAT G TTCGTAC T GA A T Brown eye GAT G TTCGTAC T GA A T Haplotypes AG- 2/6 GTA 3/6 AGA 1/6 SNP SNP S NP 重组热点划分成的单倍型块（ haplotype block ） 在单倍型块中选取标志性位点（ tagSNP ） 基本概念 ? allele, allele frequency, genotype, phenotype ? genetic makers ? recombination ? linkage ? linkage disequilibrium (LD), D, linkage map ? haplotype ? 疾病对象收集 ? 家系收集 ? 如何从疾病入手 ? 疾病家系分析 疾病对象收集 疾病对象包括： ? 疾病家系 ? 同胞对 ? 散发患者，三口之家 ? 设立对照（隔离群体，随机群体） 家系收集 ? 3 ～ 4 代以上 ? 有多个患者 ? 疾病确诊 ( 客观标准 ) ? 该疾病的外显率要高 ( 外显不全？ 延迟显 性？ ) ? 注意收集其他理化指标 如何从疾病入手 1. 诊断患者异常 a. 患者的生化异常 代谢异常 , 酶异常蛋白异常 b. 患者的形态学特征异常 短指 / 趾 c. 患者的行为学特征异常 唐氏综合征患者智力低下 2. 从临床异常 --- 蛋白异常 ---- 基因异常 第六章 多基因遗传病 数量性状的多基因遗传 Minor gene : 微效基因 Major gene : 主效基因 Additive effect : 累积效应 Polygenic inheritance : 多基