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虾肝肠胞虫 LAMP 检测方法的建立
关键词 对虾;肝肠胞虫;环介导等温扩增;检测
中图分类号: s945.4 文献标志码: b doi : 10.19415/ki.1673-890x.2018.09.058
1 材料与方法
1.1 试验材料和仪器设备
采自天津市东丽区华明街胡张庄村的南美白对虾样品,具有典
型的 ehp 感染症状,经 pcr 检测并测序后确认为 ehp 感染,由本实
验室保存;经检测未感染 ehp 的对虾基因组、仅感染对虾白斑病毒
(wssv )的对虾基因组、仅感染对虾皮下及造血组织坏死病毒
(ihhnv )的对虾基因组、仅感染偷死野田村病毒( cmnv )的对虾
rna 均由本单位病原检测室提供;海洋动物组织基因组 dna 提取试
剂盒(天根生物); 10 mm dntp 、质粒提取试剂盒均购自大连宝生
物(takara );bst dna 聚合酶( neb )、钙黄绿素染料(北京蓝
谱)、甜菜碱( sigma )。pcr 仪(abi )、凝胶成像系统
(biometra )、金属浴(天根生物)、离心机( sigma )、电泳仪
(北京六一) [1] 。
1.2 方法
1.2.1 lamp 引物设计与合成
根据 genbank 发布的 ehp 基因序列及相关文献资料,选取
ehp-ssu (登录号: fj496356.1 )为靶基因,按照 lamp 引物设计原
则,使用在线设计软件 primer explorer version 5 (http :
//primerexplorer.jp/e )设计 6 条引物,分别为外引物 f3/b3 ,内引
物 fip/bip 和环引物 lf/lb ,引物由上海生工合成 [2] 。
1.2.2 lamp 反应条件优化
1.2.3 lamp 反应体系的灵敏度试验
1.2.4 lamp 反应体系的特异性试验
將天津市水生动物疫病预防控制中心病原检测室提供的仅感染
wssv 的对虾基因组、仅感染 ihhnv 的对虾基因组、仅感染 cmnv 的
对虾 rna (反转录成 cdna 后作为模板)以及感染 ehp 的对虾基因组,
同时设阴性对照和阳性对照( ssu-puc57 质粒),按照上述建立的
lamp 方法进行 ehp-lamp 检测体系的特异性分析。
1.2.5 临床样品的检测
同时利用本研究建立的 ehp-lamp 检测技术和 pcr 方法,分别对
挑选 30 尾具有典型感染 ehp 症状的对虾进行检测,并将这两种方法
得到的结果进行比较。
2 结果
2.1 ehp-lamp 的优化结果
2.2 灵敏度试验结果
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