三角枫四倍体的细胞学倍性鉴定及其重要性状的转录组解析.pdfVIP

三角枫四倍体的细胞学倍性鉴定及其重要性状的转录组解析.pdf

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符号说明 AAT :Aspartate aminotransferase ,天冬氨酸转氨酶 bp :Base pair ,碱基对 cDNA :complementary deoxyribonucleic acid ,互补脱氧核糖核酸 CDS :Coding sequences ,编码序列 Ch:chloroplast ,叶绿体 Ci:CO2 concentration,胞间二氧化碳浓度 DAP :4’ 6-diamidino-2-phenylindole ,邻苯二甲酸二烯丙酯 dd H O:distilled and deionized water,双蒸水 2 DEG :differential expressed gene ,差异表达基因 DNA :deoxyribonucleic acid ,脱氧核糖核酸 dsDNA:double-stranded DNA,双链脱氧核糖核酸 EB :ethidium bromide,溴化乙锭 FC :Fold Change ,差异倍数 FCM : Flow Cytometry,流式细胞仪 FDR :false discovery rate,错误发现率 FPKM :expected number of Fragments Per Kilobase of transcript sequence per base pairs sequenced,每千个碱基的转录每百万映射读取的碎片 g :Gram,克 G :grana,基粒 Gb :Gigabyte ,计算机存储单位(十亿字节) GDH :glutamic acid dehydrogenase ,谷氨酸脱氢酶 GO :Gene Ontology,基因主体 Gs:Stomatal conductance,气孔导度 h :Hour,小时 KEGG :Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ,京都基因与基因组百科全书 KOG :clusters of euKaryotic Orthologous Groups ,真核原生动物群 mg :Milligram ,毫克 ml :Milliliter ,毫升 mol :Mol,摩尔 mRNA :Messenger RNA ,信使核糖核酸 NCBI :National Center for Biotechnology Information ,美国国立生物技术信息中心 NR :NCBI non-redundant protein in sequences ,非冗余蛋白序列数据库 NT :NCBI nucleotide in sequences ,美国国家生物技术信息中心(NCBI )官方的核酸 序列数据库 nt :nucleotide ,核苷酸 OD :optical density ,光密度 ORF:Open Reading Frame,开放阅读框 O :Osmiophilic,嗜饿颗粒 PCR :Polymerase Chain Reaction ,聚合酶链式反应 PI :propidium iodide ,碘化丙啶 Pn :photosynthetic rate ,净光合速率 POD :peroxidase ,氧化氢酶 r/min :Rotations per minute ,转速 RIN :RNA integrity number ,RNA 完整值 RNA :Ribonucleic Acid ,核糖核酸 RNA-Seq:Ribonucleic Acid sequencing ,转录组测序技术 RPKM :Reads Per Kilobase per Million mapped reads ,每千个碱基的转录每百万映射读 取 RT-qPCR :Real Time Quantitative PCR ,实时荧光定量PCR 技术 Sg :starch grains,淀粉粒 Tr :Transpiration,蒸腾速率 ul :Microlitre,微升 μg:Microgram,微克 目录 中文摘要 I Abstract III 1 引言1 1.1 三角枫概述1 1.2 多倍体研究2 1.3 多倍体的形成3 1.3.1 自然突变形成植物多倍体3 1.3.2 人工诱导形成植物多倍体3 生物学方法3 物理学方法4

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