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3、电泳结束后,切断电源,取出凝胶,EB 染色(5min)。 4、电泳结果分析: ①紫外检测仪直接观察电泳条带 ②凝胶成像系统拍照 ③观察电泳带及其位置,并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产物的大小,判断基因型。 电泳操作步骤 1 2 3 4 5 6 7 8 1 2 3 4 5 6 7 8 (-? 3.7/-? 3.7) (-? 4.2/ -? 4.2) (-? 3.7 / --SEA ) (-? 3.7/ -? 4.2) (-? 4.2 / --SEA ) (?? / -? 4.2) (?? / -? 3.7) (??/--SEA ) 注意事项 实验用具和溶液均有可能受到染料的污染,操作过程应戴手套! 2 加样时小心操作,?枪头伸入孔中上部缓慢加入,避免损坏凝胶或将样品槽底部凝胶刺穿。 3 本体系含有正常对照条带,无论有无发生缺失,每个样本至少应有一条电泳条带,否则,提示扩增失败,应重新检测 α-地贫实验原理 考虑到四对引物要在同一管扩增并通过电泳来判断结果,设计引物位置时各PCR产物的条带大小要有区别,最终-α3.7、αα、-α4.2和—SEA的扩增条带分别约为:2.0kbp、1.7kbp、1.4kbp和1.2kbp 电泳条带与基因型的对应关系 条带大小 基因型 基因型 条带大小 2.0 kb -α3.7 1.4 kb -α4.2 1.7 kb αα 1.2 kb --SEA LOGO * 不同大小的DNA需要用不同浓度的琼脂糖凝胶进行电泳分离。一定大小的DNA片段在不同浓度的琼脂糖凝胶中的迁移率是不相同的。 相反,在一定浓度的琼脂糖凝胶中,不同大小的DNA片段的迁移率也是不同的。 * * 琼脂糖凝胶分离大分子DNA实验条件的研究结果表明,在低浓度、低电压下,分离效果较好。 随着电压的增高,电泳分辨率反而下降,对于大分子DAN片断。电场强度不宜高于5V/cm。 但对于小片断的DNA可以5-20 V/cm电压电泳 * 吖啶橙(AO)是一种荧光色素,可与核酸亲和的荧光活体染料。荧光显微镜下核呈绿色,细胞质呈黄色。吖啶橙AO常与溴化乙啶EB合用双染. 吖啶橙染液有毒,操作时要戴手套,需避光。 染料存在时,线状DNA电泳迁移率降低约15% 在凝胶中没有EB时,DNA条带更为清晰,当需要知道DNA片断的准确大小时,可以在无EB情况下电泳,电泳结束后用EB染色 染色方法:将凝胶浸入含有EB(0.5ug/ml)的电泳液中,室温下30-45min。染色完毕后通常不需要脱色。在检测小量DNA(10ng)时,需要脱色,具体方法为将染色后的凝胶浸入水中或1mmol/LMgSO4中,室温脱色20min * 50X储存液,pH8.5:242gTris碱,57.1ml冰醋酸,37.2?g?Na2EDTA.2H2O,加至1L; * 标准型:2个α珠蛋白基因缺失或缺陷,故有相当数量的α链合成,病理生理改变轻微 中间型:α地贫是由3个α珠蛋白基因缺失或缺陷所造成,患者仅能合成少量α链,其多余的β链即合成HbH(β4)。HbH??对氧亲合力较高,又是一种不稳定血红蛋白,容易在红细胞内变性沉淀而形成包涵体,造成红细胞膜僵硬而使红细胞寿命缩短 * 4个α珠蛋白基因均缺失或缺陷,以致完全无α链生成,因而含有α链的HhA、HbA2和HbF的合成均减少。患者在胎儿期即发生大量γ链合成γ4(Hb??Barts)。Hb??Barts对氧的亲合力极高,造成组织缺氧而引起胎儿水肿综合征。。 * 3 指示剂一定要在电泳前加入,指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液;(一般为:溴酚兰,二甲苯青) 作用:①预知电泳的速率及方向;②使样品呈现颜色,便于加样; ③一些高浓度蔗糖或其它物质增加DNA的密度,可以防止DNA的扩散 染色剂即可以在电泳前加入样液,又可以电泳后再对凝胶染色;(溴化已锭[EB]、硝酸银、Goldview染料) 作用:呈现出核酸电泳后的带型。 4 丈夫基因型(αα/-α3.7)妻子基因型(αα /--SEA),其小孩有可能的基因型是? * 1 DNA提取量少 实验材料不佳或者量少、裂解不充分、沉淀不完全、洗涤时DNA丢失 DNA不纯: DNA含有蛋白、多糖、多酚类杂质 、 DNA溶解前有酒精残留,酒精抑制后续酶解反应、 DNA有残留的金属离子 DNA降解; 反复冻融、保存不当 2 DNA模板未加进去 3 个别试剂问题 体积 ? 4 凝胶,电泳液,
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