基于BSR_seq技术的大麦黄花_省略_E_HOR3298_的定位与克隆_时基于BSR-seq技术的大麦黄花叶病广谱抗性基因eIF4EHOR3298的定位与克隆丽洁.pdfVIP

摘要 大麦黄花叶病是一种土传病毒病害，由大麦黄花叶病毒（BaYMV ）和大麦温和花 叶病毒（BaMMV ）引起，两种病毒均属于马铃薯Y 病毒科，严重威胁欧亚地区冬大麦 粮食生产。在自然条件下，部分大麦种质资源对黄花叶病具有遗传抗性，将抗性基因导 入栽培大麦品种中，可以有效防止病害发生，是当前农业生产中广泛采用的防控手段。 然而，目前用于大麦育种的抗性种质或抗性基因不足以支撑病毒株系的快速分化。前期 工作发现了一份伊朗大麦种质资源HOR3298 ，它对德国的BaYMV 和BaMMV 表现出 了完全抗性。本研究通过HOR3298 与大麦品系W757/612 杂交构建F2 遗传作图群体， 使用集群分离分析法结合 RNA 测序（BSR-seq ）、等位测验和单倍型分析，克隆了 HOR3298 携带的抗性基因，并发展了功能性分子标记。主要研究结果如下： 1. 大麦品种HOR3298 与广泛使用的携带抗性遗传位点的品种相比，在德国和中国 的多年多点试验中显示出对多种BaYMV / BaMMV 分离株的广谱抗性，包括rym4/rym5 和rym1/11 的致病型毒性株系，所以可用于大麦黄花叶病抗性育种。 2. 运用BSR-seq 策略，在“HOR3298” x “W757-612”的F2 群体中构建抗感池，进行 RNA 转录组测序，根据SNP index 的方法最终将目标区段定位在染色体3H 的长臂末端， 利用等位测验方法发现HOR3298 携带的抗性基因与rym4 互为等位关系。 3. 通过对宿主因子真核生物蛋白翻译起始因子eIF4E （编码rym4/rym5 ）测序，发 现HOR3298 携带一种罕见的新型eIF4E 单倍型，命名为eIF4EHOR3298 ，其在编码序列中 含有特有的G-A 核苷酸突变（565-bp ）。比对1907 份大麦种质资源发现（1/1907），该 变异属于稀有变异，我们开发和测试了功能性分子标记，可以对该抗性等位基因进行精 确选择，辅助大麦抗病育种。 关键词: BaYMV/BaMMV ；病毒抗性；BSR-seq；eIF4E ；rym4/rym5 I Abstract The soil-borne yellow mosaic virus disease caused by different strains of Barley yellow mosic virus (BaYMV) and Barley mild mosaic virus (BaMMV) is a major threat to winter barley (Hordeum vulgare L.) production in Europe and East Asia. Some barley germplasms exhibited the genetic resistance to the barley yellow mosaic disease, and deployment of resistance genes into barley varieties can prevent the disease occurrence. However, the exploration of resistant germplasm or casual genes for barley breeding is rather limited in relation to the rapid diversification of viral strains. Previously, we identified an Iranian barley landrace HOR3298, which showed complete resistance to isolates of BaYMV and BaMMV in Germany. Within this st