不同发育阶段水稻种子代谢多样性及其遗传基础研究.pdfVIP

不同发育阶段水稻种子代谢多样性及其遗传基础研究 目录 摘要 i ABSTRACT iii 缩略词表 v 1 前言 1 1.1 代谢组学研究概述 1 1.1.1 代谢物和代谢组学的概念 1 1.1.2 代谢组学研究的分析方法 2 1.2 植物代谢组研究 6 1.2.1 植物代谢组多样性 6 1.2.2 植物代谢物积累模式 7 1.3 植物代谢组多样性的遗传基础和研究策略 11 1.3.1 植物代谢组的自然变异 13 1.3.2 代谢组学全基因组关联分析 14 1.3.3 植物代谢组遗传连锁分析 16 1.4 水稻种子代谢组研究进展 18 1.5 植物代谢组学在水稻育种中应用 19 1.6 本研究的目的和意义 20 2 材料与方法 21 2.1 材料 21 2.1.1 水稻材料来源 21 2.1.2 载体和菌株 21 2.1.3 实验试剂 22 2.2 试验方法 23 2.2.1 代谢样品准备及取样 23 2.2.2 代谢样提取 24 2.2.3 代谢样检测的仪器条件和参数 24 2.2.4 数据处理 25 I 华中农业大学 2020 届博士研究生学位 （毕业）论文 2.2.5 mQTL 定位25 2.2.6 载体构建和水稻遗传转化26 2.2.7 水稻 DNA 提取 27 2.2.8 水稻 RNA 提取 27 2.2.9 基因表达量检测27 2.2.10 生物信息学分析28 3 ．结果29 3.1 不同发育阶段水稻种子代谢谱研究29 3.1.1 籼稻自然品种不同发育阶段种子代谢谱29 3.1.2 MH63 和 ZS97 灌浆期、成熟期和萌发期种子代谢谱分析32 3.1.3 RIL 群体不同发育阶段种子的代谢谱分析 35 3.2 水稻不同发育阶段种子的 mQTL 研究39 3.2.1 mQTL 定位及统计分析39 3.2.2 mQTL 在染色体上分布42 3.3 筛选候选基因46 3.3.1 L-天冬酰胺的候选基因LOC_Os06g03990 46 3.3.2 LOC_Os06g03990 的基因结构与表达模式48 3.3.3 LOC_Os06g03990 的蛋白结构预测49 3.3.4 其他代谢物候选基因筛选51 3.3.5 利用转基因材料验证候选基因功能56 3.4 代谢物-代谢物和代谢物-农艺性状相关性分析 58 3.4.1 代谢物-代谢物相关性网络分析58 3.4.2 代谢物-农艺性状相关性网络分析62 3.5 水稻糙米和精米代谢谱研究64 3.5.1 籼稻自然品种糙米代谢谱65 3.5.2 MH63 和 ZS97 的糙米和精米代谢谱分析66 4 讨论67 4.1 植物代谢组多样性67