生物化学：第四章 核酸.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 牛脾磷酸二酯酶水解游离出3’-核苷酸;蛇毒磷酸二酯酶水解游离出5’-核苷酸. * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5月8日作业 分子跨膜运输的方式，以Glucose转运为例。（动画，讲演）。 DNA电泳的原理和DNA纯度评估方法。 DNA与RNA的比较（列表，包含化学组成、结构、生物学功能，理化性质差异）。 以丙酮酸脱氢酶体系为例，说明各类辅酶的作用（图示）。 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 碱基形状扁平，分布于双螺旋内侧。大量的碱基层层堆积，相邻碱基的平面十分接近，这样，芳香环上N原子π电子云交错产生一定的吸引力，就是碱基堆积力。 碱基呈疏水性，双螺旋结构内部形成一个强大的疏水区，消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响，利于碱基之间形成氢键。 所以碱基堆积力是DNA双螺旋稳定的 最主要因素。 ②碱基堆积力 ③ 另外，各种阳离 子，如多胺，组蛋白，Na+,K+,Mg 2+能与DNA分子中带负电荷的磷酸基团作用，降低了两条DNA链之间的静电排斥力，也有助于双螺旋的稳定 改变介质条件和环境温度，将影响双螺旋的稳定性。 2.0 nm 小沟 大沟 DNA双螺旋结构特点 双螺旋结构的稳定因素 双螺旋结构类型 5、二级结构的其它类型 Watson和Crick提出的DNA双螺旋构象现在称为B-DNA,它代表DNA钠盐在相对湿度92%制得的纤维的结构，比较接近生理条件下细胞内大部分DNA的构象。 DNA还有其它双螺旋构象类型:A,C,D,E,Z型。另外还有三股螺旋DNA。 ① A-DNA DNA钠盐在相对湿度75%以下制得的纤维具有不同于B-DNA的结构特点，称为A-DNA。A-DNA也是反平行双链形成的右手双螺旋。 RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构 ② Z-DNA 1978年，Rich等人将人工合成的六聚体DNA片断d(CGCGCG)制成晶体，并进行了X-衍射分析，发现此片断是反平行左手双螺旋结构，称为左旋DNA ,或称Z-DNA。 天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA(由于在Z-DNA中磷酸根距离太近,具有相斥作用,则导致不稳定---潜在的解链位点)。 Z-DNA与B-DNA可互相转化，并处于某种平衡状态，一旦这种平衡状态被破坏，基因表达可能失控，推测Z-DNA可能和基因表达的调控有关。 ③ 三股螺旋DNA （ triplex) DNA的二级结构除了双螺旋结构，还存在三条链形成的螺旋结构，即三股螺旋结构。 K. Hoogsteen 1963首先描述了三股螺旋结构(Ts-DNA) ts-DNA TAT Hoogsteen氢键 Ts-DNA H-DNA CGC+ 三股螺旋结构通常是一条同型寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟结合： 几种DNA螺旋结构的参数 类 型 碱基倾角 碱基间距 （nm） 每圈碱基数 螺 距 (nm) 螺旋直径 （nm） B-DNA A-DNA Z-DNA ? 0-1? 19-20? 9? 6o ? 0.34? 0.23? 0.38 0.331 ? 10? 11? 12 9.3 3.32-3.4? 2.46-2.53? 4.56 3.1 ? 2.0-2.37? 2.55? 1.8-1.84 C-DNA D-DNA tsDNA A-DNA 噬菌体??174DNA为单链 核酸的化学组成与分子组成 核酸的分子结构 DNA的一级结构 DNA的二级结构及类型、维持二级结构稳定的作用力（B-DNA） 复习 P156:回文结构和镜像重复 1、定义： DNA的三级结构指DNA分子（双螺旋）通过扭曲和折叠所形成的特定构象。包括不同二级结构单元间、单链与二级结构单元间的相互作用以及DNA的拓扑特征。超螺旋是DNA三级结构的一种类型。超螺旋即DNA双螺旋的螺旋。 超螺旋是DNA三级结构的主要形式（-双螺旋的螺旋） （三）?DNA的三级结构 B-DNA双螺旋中每10个核苷酸长度旋转一周，这时双螺旋中没有张力，处于能量最低状态。 当将此线型DNA连接成环状时，此环状DNA为松弛型。 超螺旋的形成 以一段由260个碱基对组成的线型B-DNA（螺周数260/10.4=25）为例 如果将这种正常双螺旋拧松两周，就会使双螺旋内的原子偏离正常位置，产生张力。 如果双螺旋的末端是开放的，则张力可通过链的转动而释