生物化学：第二章 核酸b.ppt

(二) RNA的高级结构特点 RNA是单链分子，因此，在RNA分子中，并不遵守碱基种类的数量比例关系，即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 RNA分子中，部分区域也能形成双螺旋结构（类似A-DNA双螺旋结构），不能形成双螺旋的部分，则形成突环。这种结构可以形象地称为“发夹型”结构或茎环结构。 在RNA的双螺旋结构中，碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外，也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。 tRNA中除了常见的碱基外，还存在一些稀有碱基，这类碱基大部分位于突环部分. tRNA的高级结构 1、tRNA的二级结构 tRNA的二级结构大都呈“ 三叶草” 形状，在结构上具有某些共同之处，一般可将其分为四臂四环：包括氨基酸接受臂、反密码（环）臂、二氢尿嘧啶（环）臂、T?C（环）臂和可变环。除了氨基酸接受区外，其余每个区均含有一个突环和一个臂。 (1)氨基酸接受区包含有tRNA的3? -末端和5?-末端， 3?-末端的最后3个核苷酸残基都是CCA，A为腺苷酸。氨基酸可与其成酯，该区在蛋白质合成中起携带氨基酸的作用。(2)反密码区与氨基酸接受区相对，一般环中含有7个核苷酸残基，臂中含有5对碱基。其中环正中的3个核苷酸残基称为反密码子。 （3)二氢尿嘧啶区 该区含有二氢尿嘧啶。环由8-12个核苷酸组成，臂由3-4对碱基组成。 (4) T?C区 该区与二氢尿嘧啶区相对， 假尿嘧啶核苷酸—胸腺嘧啶核糖核苷酸环(T?C)由7个核苷酸组成，通过由5对碱基组成的双螺旋区(T?C臂)与tRNA的其余部分相连。除个别例外，几乎所有tBNA在此环中都含有T?C 。 (5)可变区 位于反密码区与T?C区之间，不同的tRNA该区变化较大，一般有3-18个核苷酸组成。 2、tRNA的三级结构 在三叶草型二级结构的基础上，突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对，目前已知的tRNA的三级结构均为倒L形。 siRNA和miRNA介绍： 小的干涉RNA（small interfering RNA; siRNA） 和微小RNA（microRNA；miRNA）是两种序列特异性地转录后基因表达的调节因子，是小RNA的最主要组成部分，它们的相关性密切，既具有相似性，又具有差异性。 小的干涉RNA（siRNA）是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA，由约20个碱基对组成。SiRNA在RNA沉默通道中起中心作用，是对特定（特异性强）信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素。 miRNAs是一种21－25nt长的单链小分子RNA，其结构特征如下：广泛存在于真核生物中，是一组不编码蛋白质的短序列RNA，它本身不具有开放阅读框（ORF）；成熟的miRNA，5′端有一个磷酸基团，3′端为羟基，这也是它与相同长度的功能RNA降解片段的区分标志。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。 miRNA表达的时序性和组织特异性提示人们miRNA的分布可能决定组织和细胞的功能特异性，也可能参与了复杂的基因调控，对组织的发育起重要作用。 核酸与蛋白质复合物的结构 生物体内的核酸通常与蛋白质结合形成复合物，以核蛋白的形式存在。 DNA分子十分巨大，将它组装在有限的空间内，需要高度组织，用压缩比来表示。即：DNA分子长度与组装后特定结构长度之比称为压缩比。 1.病毒：病毒颗粒主要由蛋白质和核酸及脂质、糖类组成。动物病毒主要为DNA病毒，植物病毒主要为RNA病毒。核酸是遗传物质，而蛋白质与病毒宿主的专一性有关，同时可以保护核酸免受损伤。 核酸位于病毒粒子的中心,蛋白质包围在核酸外面,形成衣壳,并决定病毒粒子的外形。 病毒的侵染性由核酸引起,蛋白质无侵染性,仅起保护作用或识别宿主细胞表面位点。 2.细菌的拟核 细菌基因组为双链环状DNA，与碱性蛋白和少量RNA结合，形成突环结构。其DNA分子的长度大约是其菌体长度的1000倍。所以细菌DNA在细胞内紧密缠绕形成致密的小体，称为拟核（nucleoid）. 3.真核生物的染色体(核蛋白) DNA双链以左手螺旋缠绕在组蛋白形成的八聚体核心上即核小体 念珠状结构 核小体链进一步盘绕、折叠形成染色质丝 组成突环 玫瑰花结 螺线圈 由螺线圈组装成染色单体。 真核生物的染色质丝 一、核酸的一般物理性质 DNA为白色纤维状固体，RNA为白色粉末状固体，都微溶于水，其钠盐在水中的溶解度较大。但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有机溶剂。（用乙醇从溶液中沉淀