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第15章
核酸物理化学性质;一、核酸的水解;5′端;核酸的酸水解;核酸的碱水解;核酸的酶水解;核酸酶的分类Ⅰ;核酸酶的分类Ⅱ;二、核酸的酸碱性质;;;2、核苷的解离
戊糖可增强碱基的酸性解离
核糖中的羟基也可发生解离
3.核苷酸的解离
磷酸基使核苷酸具有很强的酸性;;
DNA等电点为4~4.5;
RNA等电点为2~2.5
;三、核酸的紫外吸收;核酸溶液紫外吸收以摩尔磷的吸光度表示,摩尔磷即相当于摩尔核苷酸。;OD260的应用:
1. DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于
50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA)
20μg/ml寡核苷酸
2.判断核酸样品的纯度
DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8
RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0
含杂蛋白及苯酚,降低
3.判断DNA是否变性;四、核酸的变性、复性与杂交; 某些理化因素破坏了氢键和碱基堆积力,
使核酸分子高级结构改变、理化性质及
生物活性发生改变。
不涉及磷酸二酯键断裂,一级结构不变;降解:核苷酸骨架上3’,5 ’-磷酸二酯键的断裂; 高温(一般>75℃)— 热变性
强酸、碱 — 酸碱变性
甲醛(Agarose中RNA )
尿素(PAGE中DNA )
; OD260增高 粘度下降
比旋度下降 浮力密度升高
酸碱滴定曲线改变 生物活性丧失;完全变性后核酸紫外吸收值增加:
天然DNA 25-40%、RNA 约1.1%
实质:碱基暴露;DNA变性;5、DNA热变性的特征;
指增色效应达50%时的温度
一般DNA Tm 值在85 - 90 ?C之间;(1)DNA的均一性:
(2)G-C含量:
经验公式: XG+C=(Tm-69.3)×2.44
(3)介质中的离子强度:
;(二)核酸的复性(renaturation);DNA复性;分子量越大复性越难;
浓度越大,复性越容易;
DNA复性也与它本身组成和结构有关
(具有很多重复序列DNA,复性快)。
减色效应(低色效应)
——;(三) 核酸的杂交;DNA-DNA
杂交双链分子; Southern杂交
Northern杂交
Western杂交;核酸的碱水解;核酸的酶水解;核酸酶的分类Ⅱ; 某些理化因素破坏了氢键和碱基堆积力,
使核酸分子高级结构改变、理化性质及
生物活性发生改变。
不涉及磷酸二酯键断裂,一级结构不变;完全变性后核酸紫外吸收值增加:
天然DNA 25-40%、RNA 约1.1%
实质:碱基暴露;5、DNA热变性的特征;(1)DNA的均一性:
(2)G-C含量:
经验公式: XG+C=(Tm-69.3)×2.44
(3)介质中的离子强度:
;(三) 核酸的杂交
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