微生物学微生物的分类和鉴定.pptxVIP

第十章 微生物的分类和鉴定;界 门 纲 目 科 属 种;（一）双名法 指一个物种的学名由前面一个属名和后面一个种名加词两部分组成 学名=属名+种名加词+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份 例：大肠埃希氏菌（大肠杆菌） Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 ( 二) 三名法 当某种微生物是一个亚种或变种时，学名就按三名法拼写。 学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词 ;属的模式;当微生物名称是一个亚种（subspecies，简称“subsp．”，排正体???）或变种（variety，简称“var．”，排正体字）时，学名就应按“三名法”构成，即：;1 .属名 是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数第一个字母应大写。 芽孢杆菌属：Bacillus 可缩写成B. 或 Bac. 2、种名 种名加词又称种加词，它代表一个物种的次要特征。 字首一律小写，可由形容词或名词组成， B. subtilis 。;（四）种(species) 种是一个基本分类单元，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有着明显差异的一大群菌株的总称。 典型菌株(type strain)、模式种(type species) ;新种(species nova, sp. nov)：是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。;变种(Variety) ：一个微生物的种的某种特性已起了明显的变化，这种特性的改变是与过去人们在自然界中分离获得的菌种所描述的特性相比较而确定的，而且这种变异的特性又是比较稳定的，这种变异的菌株称为变种。;（五）菌株(strain) 又称品系（在非细胞型的病毒中则称毒株或株），表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒粒）繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。 模式菌株（Type strain)：是一个种的具体活标本，必须是该菌种的活培养物，是由一个被指定为命名的模式菌株传代而来。;斑马鱼肠道中一株红酵母（Rhodotorula）的鉴定与系统发育分析 戚冰洁 胡秀彩 顾丹 梁爽 吕爱军* （徐州师范大学生命科学学院，江苏 徐州 221116） 摘要：采用马铃薯葡萄糖培养基（PDA），从野生斑马鱼肠道中分离到一株酵母菌，编号为ZF-2，进行形态学观察、生理生化特征、PCR扩增26S rDNA D1/D2区以及基因测序分析，并构建系统发育进化树。结果表明ZF-2分离株为粉红色菌落、菌体呈椭圆形，出芽繁殖；可以同化利用葡萄糖、乳糖、蔗糖等糖类，基本符合红酵母属（Rhodotorula）特征，初步确定为红酵母。PCR扩增获得26S rDNA D1/D2区序列长度为642bp (HQ323251)，采用BLAST和ClustalX程序进行序列比对分析，结果表明与斯鲁菲亚红酵母（R. Slooffiae）序列相似性在99%-100%之间，构建的系统发育进化树显示菌株ZF-2与R. Slooffiae (EU583485)关系最近，最终鉴定ZF-2菌株为斯鲁菲亚红酵母。这是首次从斑马鱼肠道中分离到斯鲁菲亚红酵母。 关键词：斑马鱼，红酵母，分离鉴定，序列分析;草鱼肠道中弗氏柠檬酸杆菌的分离鉴定与PCR-SSCP分析 郑璐1，吕爱军1*，胡秀彩2，曹成亮1，蒋继宏2 (1.徐州师范大学生命科学学院，江苏 徐州 221116； 2.江苏省药用植物生物技术重点实验室，江苏 徐州 221116) 摘要：从草鱼（Ctenopharyngodon idellus）肠道中分离到3株细菌，暂时编号为Ci-1、Ci-7和LCi-40，结果表明3株菌株均为弗氏柠檬酸杆菌（Citrobacter freundii）；系统发育分析结果表明，3株弗氏柠檬酸杆菌16S rDNA序列与DSM 30039模式株同源性分别为99.59%、99.47%和99.53%，且位于系统发育树的同一分支。 关键词：草鱼；弗氏柠檬酸杆菌；致病性；16S rDNA;第二节 微生物在生物界的地位;R.H.Whittaker (1969) proposed a five kingdom classification. The kingdoms defined by him?were named Monera, Protista, Fungi, Plantae Animalia.;三域学说： 1977年，美国C.R.Woese等人对大量微生物和其他生物进行16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与以往各种界级分类不同的新系统，称为三