oncomine数据库的应用.ppt

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Oncomine数据库的应用 第一页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 一、账号注册 需要非盈利机构邮箱(大学邮箱)注册账号 第二页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 二、登陆 第三页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 三、登陆后的用户主界面 第四页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 四、键入要搜索的基因 第五页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 五、限制搜索条件 1、Analysis Type-Differential Analysis-Cancer vs. Normal Analysis 第六页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 3、Cancer Type-Prostate Cancer 第七页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 4、Sample Type-Clinical Specimen 第八页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 5、Data Type-mRNA 第九页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 我们选定的条件会出现在筛选框中,点击搜索,右边的界面如下图 六、按限定的条件搜索 第十页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果 第十一页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 勾选各研究机构所做的研究 七、对多组数据进行meta分析 第十二页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 对所勾选的结果进行合并,进行meta分析 第十三页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 研究结果为该基因高表达的机构 第十四页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 研究结果为该基因相对低表达的机构 第十五页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 选择一个较为可信的机构作数据统计并分析 八、结果分析 第十六页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 展开该机构右边的下拉箭头,点击其下方的研究,会出现右边所示柱状图 第十七页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 将鼠标移至每个柱子上,会分别跳出一个说明框,统计每个柱子的Expression value 第十八页,编辑于星期二:十三点 三十六分。 分别统计正常前列腺和前列腺癌的expression value并用GraphPad Prism 5作图 九、作散点图 第十九页,编辑于星期二:十三点 三十六分。

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