跨膜区分析-课件.pptVIP

跨膜区分析(TMHMM） 跨膜区分析(TMHMM） 蛋白质含有跨膜区，提示它可能作为膜受体起作用，也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。 跨膜区常见的分析软件有TMHMM.TMPERD.TMP。TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序，它综合了跨膜区疏水性、电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质，可对跨膜区及膜内外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长，故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。 SIB 步骤一： 打开在线工具， 步骤二：提交序列 步骤三：参数设置 参数介绍： Extensive, with graphics（图形化显示） Extensive, no graphics （不以图形化显示） One line per protein（每个蛋白遵行显示） 步骤四：显示结果 结果解读 结果显示： P8蛋白的1--405位氨基酸位于细胞膜表面，406--426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区。 结果显示： 与该蛋白的疏水性区域分析结果基本一致，表明P8蛋白可能是一个与细胞信号传导有关的膜受体蛋白。 我们，还在路上…… You made my day! 反思自我时展示了勇气，自我反思是一切思想的源泉