微量组织高通量蛋白质组学在人群大队列中的应用.pptVIP

汇报人：夏超 蛋白质组学 1.起源：蛋白质与基因组的组合 2.研究对象：生物样品（细胞、组织或体液等） 3.研究方向：定性及定量（较为常见） 定量可以分为以下两个方法 着色法（传统蛋白分离、胶内酶解与飞行时间质谱鉴定） 鸟枪法（酶解，分离，LC-MS/MS分析） 4.研究意义：蛋白质组学集中于动态描述基因调节，对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定，鉴定疾病、药物对生命过程的影响，以及解释基因表达调控的机制 5.研究领域：蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用 质谱蛋白质组学的三种策略 蛋白质 酶解 肽段 DDA（数据依赖采集模式） 鸟枪法（shot-gun） 传统方法 重复性差、定量不精准、数据缺失多、低丰度蛋白难检测等固有缺点 DIA（数据非依赖采集） 新兴方法，兼具DDA的高通量和Targeted的精准性 Targeted（靶标法） 几十到上百个目标蛋白提供精确的绝对定量结果，重复性很高，质谱绝对定量的金标准。但通量相对较低，无法开展高通量蛋白的精确定量。 肽分离与电离 微量组织高通量蛋白质组优势 多种组织类型 血清/血浆、尿液、眼泪、脑脊液、唾液、活检组织、冰冻组织、石蜡包埋组织、石蜡切片、细胞、毛发、牙齿、指甲 极小样本量 例如细胞样本（1×105）；新鲜组织器官（0.1mg）；眼泪（9mm2）；血清/血浆（1-10μL）；尿液（100μL） 高重现性和高通量 以质谱（MS）技术为核心，不断开发出质谱鸟枪法(Shot-gun)、毛细管电泳-质谱联用 (CE-MS)等新策略直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。 血液中含有许多以前未被研究的生物标志物，可以反映所有组织的正在进行的生理状态。体内的每个细胞都会在其流到血液中的产品中留下其生理状态的记录，既可以作为废料也可以作为向邻近细胞的信号 细胞。 血液 尿液 尿蛋白和多肽的70％来自肾脏和泌尿道，而其余30％来自循环系统。 每天约有900升血浆流经肾脏，其中超过99％的原始尿液被肾小管吸收。 诊断甲状腺疾病的基因组测试 诊断不确定的甲状腺结节。随后的研究表明，GEC可疑结节的手术组织病理学报告的阳性预测值存在显着差异（16-57％）；缺乏的敏感性（83-100％）和特异性（10-52％） GEC良性结节的长期随访和/或GEC发现的组织病理学相关性。 总体而言，低特异性排除了其作为常规检测的用途，并且至少应出于诊断目的对GEC可疑甲状腺结节进行甲状腺切除术。