蛋白质的结构与功能兼容.pptVIP

第30页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （四）?-转角 ?-转角 也称β-回折，存在于球状蛋白中。其特点是肽链回折180°，使得第一个氨基酸残基的C=O和与第四个残基的N-H形成氢键。 第31页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （四）无规卷曲 无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 第32页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （五）二级结构可组成蛋白质分子中的模体 二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，称为模体(motif) ，也被称为超二级结构。 第33页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 α-螺旋-β转角（或环）-α-螺旋模体 链-β转角-链模体 链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体 模体常见的形式 第34页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 第35页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （六）氨基酸残基的侧链影响二级结构的形成 蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。 第36页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 多聚丙氨酸在pH7的水溶液中能形成α-螺旋， 多聚异亮氨酸不能形成α螺旋， 多聚脯氨酸不能形成α螺旋。 多聚赖氨酸在pH7不形成α螺旋，而在pH12时自发形成α螺旋。 实例 1、?-螺旋 肽链中脯氨酸经常形成β-转角， 肽链中甘氨酸经常形成β-转角。 2、?-转角 第37页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 三、多肽链在二级结构基础上进一步折叠形成三级结构 疏水键、离子键、氢键和 范德华力等。 主要的化学键: 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 定义: （一）三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置 第38页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 肌红蛋白 (Mb) N 端 C端 第39页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 第40页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （二）结构域是三级结构层次上的独立功能区 分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密且稳定的区域，并各行其功能，称为结构域 (domain) 。 大多数结构域含有序列上连续的100至200个氨基酸残基，若用限制性蛋白酶水解，含多个结构域的蛋白质常分解出独立的结构域，而各结构域的构象可以基本不改变，并保持其功能。 超二级结构则不具备这种特点。 因此，结构域也可看作是球状蛋白质的独立折叠单位，有较为独立的三维空间结构。 第41页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 3-磷酸甘油醛脱氢酶亚基的结构示意图 第42页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 （三）蛋白质的多肽链须折叠成正确的空间构象 分子伴侣(chaperon)通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。 分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开，如此重复进行可防止错误的聚集发生，使肽链正确折叠。 分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合，使之解聚后，再诱导其正确折叠。 分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确形成起了重要的作用。 第43页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 亚基之间的结合主要是氢键和离子键。 四、含有二条以上多肽链的蛋白质具有四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。 许多功能性蛋白质分子含有2条或2条以上多肽链。每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基 (subunit)。 第44页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 由2个亚基组成的蛋白质四级结构中，若亚基分子结构相同，称之为同二聚体(homodimer)，若亚基分子结构不同，则称之为异二聚体(heterodimer)。 血红蛋白的四级结构 第45页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 五、蛋白质的分类 根据蛋白质组成成分: 单纯蛋白质 结合蛋白质 = 蛋白质部分 + 非蛋白质部分 根据蛋白质形状: 纤维状蛋白质 球状蛋白质 第46页，共82页，2022年，5月20日，4点48分，星期六 蛋白质家族（protein family） : 氨基酸序列相似而且空间结构与功能也十分相近的蛋白质。 属于同一蛋白质家族的成员，称为同源蛋白质（homologous protein） 。 蛋白质超家族（supe