蛋白质的结构与功能 (5).pptVIP

借助重叠肽确定肽段次序： 末端残基 H S 末端肽段 HOWT APS （OUS） 第一套肽段 HOWT OUS EOVE RLA PS 第二套肽段 HO WTOU SEO VERL APS 推断全顺序 HOWTOUSEO VERLAPS 氨基末端残基 H 羧基末端残基 S 第一套肽段 第二套肽段 OUS SEO PS WTOU EOVE VERL RLA APS HOWT HO 举例： 所得资料 第59页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 核酸推导法 原理：蛋白质的氨基酸顺序是由核酸的核苷酸顺序决定的。 测出核酸的核苷酸顺序 根据三个核苷酸确定一个氨基酸的密码子推导出蛋白质的氨基酸顺序 第60页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 小结 掌握：片段重叠法确定肽段在多肽链中顺序； 熟记：组成蛋白质的各种氨基酸以及缩写符号； 熟悉：分析多肽链的N-末端和C-末端残基的方法； 第61页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 蛋白质分子的构象又称空间结构、立体结构、高级结构、三维构象等，是指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列、分布及肽链的走向。 蛋白质的分子构象取决于一级结构，是蛋白质生物学功能或活性所必需的。 蛋白质的构象可分为二、三、四级结构。 蛋白质的二级结构 第62页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 蛋白质的二级结构 定义 是指肽链的主链骨架中若干肽单位，各自沿一定的轴盘旋或折叠形成的有规则的构象，以氢键为主要的次级键。 蛋白质的二级结构中不涉及氨基酸残基侧链的构象。 主链：是由氨基酸的羧基与氨基形成的肽键部分规则的重复排列而成。 侧链：R基部分。 第63页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 两肽键平面的交接点为α-碳 以肽键为平面连接成多肽长链 注意：α-碳上面接有各种大小不等的基团 第64页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 肽单位（peptide unit）：肽键与相邻的两个Cα组成的基团 其中肽键具有部分双键性质，不能自由旋转。 肽单位是刚性平面，其上面6个原子处于同一平面，称为 肽平面。 肽链主链上只有两个α碳原子 连接单键可旋转。 肽单位中与C-N相连的氢和氧原子与两个α碳原子呈反向分布。 第65页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 肽链中的肽平面 第66页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 蛋白质空间结构单元 β-折叠 (β- pleated sheet) β-转角(β- turn) 环(loop) 无规则卷曲（random coil） Ribbon model of the bacterial catabolite gene activator protein (CAP) α-螺旋 (α- helix) 肽键平面对多肽链构象的限制 第67页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 肽平面的相叠形成α螺旋 第68页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 ?-螺旋(?-helix) 指蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸?-碳原子的旋转，使多肽链的主骨架沿中心轴盘曲成稳定的?-螺旋构象。 第69页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 右手?-螺旋，螺距为0.54nm，每圈含3.6个氨基酸残基；两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm; 稳定因素：链内氢键，每隔三个氨基酸残基形成一个氢键，氢键取向与主轴基本平行。 R基团在外侧，其大小、形状及电荷等均影响?-螺旋的稳定性和形成。 0.54 nm ?-螺旋结构特征 第70页，共101页，2022年，5月20日，7点51分，星期六 肽链伸展使肽键平面之间折叠成锯齿状； ?-折叠借相邻主链之间的氢键维系。 肽链中氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。 ? -折叠的结构特征 第71页，共101页，2022年，5月20日，7点5