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Peters异常PITX2及PAX6基因型表型分析
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孟 永,卢国华,谢 阳,孙新成,黄丽琴
0引言
Peters异常(Peters’ anomaly,PA)是较少见的眼前段发育不良性眼病,1906年由Peters首先报道,临床表现为先天性的角膜中央区混浊,对应区域的角膜后基质层变薄和后弹力层缺损、虹膜角膜粘连等[1]。该病在新生儿中的发病率国外报道为1.2/100000,绝大部分病例为散发,但也有一些常染色体显性及隐性遗传的报道[2-3]。Peters异常分型:按照文献描述的方法可将Peters异常分为Ⅰ型和Ⅱ型,仅有角膜混浊、虹膜前粘连而无晶状体异常者为I型,同时合并白内障或存在晶状体与角膜内皮粘连者为Ⅱ型,如果还伴有神经起源的全身异常则诊断为Peters综合征。临床中Peters异常患者可合并有其它眼部非特征性异常如巩膜化角膜、牵牛花综合征、Axenfeld-Rieger综合征(Axenfeld-Rieger syndrome,ARS)、永存原始玻璃体增生症(persistent hyperplastic primary vitreous,PHPV)等[4-5]。目前国外有Peters异常相关致病基因PITX2、PAX6等的分子遗传学的研究;而国内Peters异常PITX2和PAX6基因的报道很少[6-7]。PITX2是Paired-Bicoied同型盒蛋白家族成员,剪切翻译形成271aa,317aa,324aa三种亚型,这三种亚型同源结构域以及羧基端的序列相同,而氨基端不同,第60位的氨基酸同源结构域2(homeobox-2)可通过其内在的“螺旋-旋转-螺旋”(helix-turn-helix,HTH)结构与特异性DNA位点相结合,在发育中起着重大作用,第50位同源结构域氨基酸赖氨酸对于特异性结合DNA具有决定性作用;PAX6是眼球发育的主控基因之一,其编码产物是结合蛋白家族之一,其中的配对盒结构域和同源结构域作为高度保守的转录因子,可通过结合特定序列在视网膜、晶状体和角膜中广泛表达。在中国人群中进行该项研究,既可以了解中国人群Peters异常患者中PITX2和PAX6基因的突变情况,分析中国人群中Peters异常基因型表型的关系,为进一步研究其发病机制提供线索。
1对象和方法
1.1对象对2016-01-01/2019-03-30于常州市第二人民医院和第三人民医院就诊的15例Peters异常患者的临床资料进行分析,详细询问病史和家族史并进行PITX2和PAX6基因筛查;对发现的突变患者其家系成员均完善眼科检查,并排除全身的异常,收集临床的资料。80例正常对照者均无眼或全身遗传性疾病,和患者无任何血缘关系。遵循相关伦理原则,征得患者及所有成员的同意后抽血制备基因组DNA,并收集相关临床资料。
1.2方法
1.2.1聚合酶链反应(PCR)扩增采集Peters异常患者和所有成员外周血DNA,引物序列及扩增条件见本文作者之前发表Peters异常一文[6]。
图1正常对照者及突变患者测序图A:正常对照者;B:突变患者。
图2异源双链-单链构象多态性分析结果+:突变患者。
1.2.2突变基因筛查PCR产物纯化以后,加入BigDye双向测序反应,使用AB13730分析仪双向测序,测序发现的PITX2和PAX6新突变结果与NCBI数据库中PITX2及PAX6的序列进行比对,确定突变位点。根据人类基因组变异协会(HGVS,/)命名法对PITX2和PAX6突变进行命名。
1.2.3测序结果分析将碱基变异的测序结果输入DNAStar公司的MapDraw程序进行遗传信息改变的确定,NCBI上人类基因组数据库中,PITX2及PAX6两个基因的DNA序列作为标准序列,以识别碱基变异对氨基酸编码产生的影响。
1.2.4异源双链-单链构象多态性分析用异源双链-单链构象多态性(HA-SSCP)的方法对突变患者及其父母及80例正常对照进行对比验证。
2结果
对15例Peters异常患者PITX2和PAX6基因的外显子及邻近的内含子区域进行直接测序,15例Peters异常患者PAX6基因未能发现任何突变,患者中检测到1个已报道PITX2缺失突变c.296delG(P.R99fsx56),正常对照者及突变患者测序图对照(图1)。分析其详细临床资料,这是中国首次报道伴有ARS的Peters异常眼病PITX2基因突变。
2.1基因突变筛查Peters异常1例及ARS合并症患者中发现一PITX2基因突变,该突变为缺失突变,位于PITX2A的第五外显子内,编码区第296位的碱基G缺失,该碱基缺失的后果会导致羧基端读码框架的移位,使编码的第98位氨基酸和原蛋白发生偏离,并且移位的读码框架在编码第153个氨基酸后产生了一个提前的终止密码子,致使理
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