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- 2023-08-13 发布于山东
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提取细胞RNA的步骤
提取细胞RNA的步骤
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提取细胞RNA的步骤
提取细胞RNA的步骤:
六孔板每孔细胞中加入1mlTrizol,冰上搁置5min,枪头吹打。
将各孔裂解液吸到1.5mlEP管中,加入氯仿0.2ml/管,使劲振摇15s。15-30℃下孵育2-3min,
离心(4℃,12,000g,15min)。
离心后液体分为三层(上层-无色水样层为RNA,中层白色为DNA和基层红色为蛋白质),
当心汲取上层无色液体移入一新的
EP管中。
4)
加入等体积异丙醇,0.4-0.5ml,混匀,15-30℃下孵育
10-30min,离心(4℃,12,000g,
10min)。此中假如加入等体积异丙醇后,置于试管架上用
PE手套密封后,放于4℃冰箱中,沉
淀30min成效更好。
5)
去上清,积淀加入75%乙醇1ml,旋涡振荡
30s,离心(4℃,7,500g,5min)。
6)
当心去上清,管内积淀在超净台中鼓风静置干燥
3-5min。最好是用枪头汲取上清,
尽量除掉。
加入20ulDEPC水溶解,分装5ul/管,-70℃冰箱保存。
8)细胞总
RNA
的判定:
%琼脂糖电泳判定细胞总
RNA,察看出现条带及各条带亮度。
紫外分光光度计测定:
分别测定细胞总
RNA
在
260nm
和280nm
处的光密度值
(OD),并计算
RNA
的含量和纯度。
1、实验目的
提取人体细胞的总RNA和mRNA。
2、本实验所需试剂
1)、CNE-2细胞及培育细胞的一系列条件,
2)、PBS缓冲液,TRIZOL试剂,
3)、DEPC办理过的水、大、中、小Tip及1.5mlEP管,
4)、新的氯仿、异丙醇和乙醇,
5)、mRNA分别试剂盒:OligotexmRNAMiniKit,Cat.no.:70022,QIAGEN。
6)、新配的电泳缓冲液,专跑RNA的琼脂糖(Agarose)。
3、实验流程
3.1细胞总RNA的提取
1)、6孔板细胞(CNE-2)集合度为90-100%时,拿出无菌室,去其上清,用PBS洗两次
后,每孔加TRIZOL试剂(Gibco企业)1ml,摇匀,无菌罩内消化3-5分钟(察看:液体
变黏稠,细胞脱壁)。
2)、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC办理过的1.5mlEP管中,加新开的氯仿
0.2ml,轻摇
15秒。
3)、室温静置2-3分钟后,12000rpm,15min,4℃,离心。而后取上清无色水相(约
到EP管(DEPC办理过),加0.5ml新开的异丙醇,室温下静置10分钟。
0.6ml)
4)、12000rpm,10
分钟,
4℃,离心。察看总
RNA
在管底的白色积淀,弃去上清(当心
别丢了积淀),
75%乙醇
1.0ml
清洗(用
DEPC
水新配制)后,
7500rpm,5min,4℃离心。
5)、去上清,点离,用小Tip吸干液体。气干积淀5-10分钟,DEPC办理水20-30ul加入,中枪打匀,55-60℃水浴10分钟溶解总RNA,测OD值。
6)、电泳。
3.2从总RNA中分别mRNA(OligotexmRNAMiniKit,Cat.no.:70022,QIAGEN)
1)、取上述提取的总RNA若干(少于0.25mg)到一个新的无RNase的EP管中,用无
RNase的水定容到250ul。
2)、加入BufferOBB250ul,OligotexSuspension15ul。用Tip打匀或用手弹匀。
3)、70℃水浴,3分钟(裂解RNA的二级构造)。
4)、20-30℃条件下,静置10分钟(让Oligotex与mRNA联合)。
5)、高速离心2分钟,当心吸走上清(该上清要保存),留下约
50ul的上清在原管里。
6)、用BufferOW2400ul重悬含Oligotex/mRNA复合物的积淀,而后将这些加到套有
1.5ml
EP管的SPIN柱子上,高速离心
1分钟。
7)、将SPIN柱子移到一个新的
EP管上,加BufferOW2400ul
到柱子,高速离心
1分钟,
扔掉滤过液。
8)、将SPIN柱子移到一个新的
EP管上,加20-100ul热的(70℃)BufferOEB到柱子上,
用Tip往返吸打3-4
次,高速离心
1分钟。
9)、为保证最大的
mRNA产量,可再次重复第8步。
10)、电泳。
4、mRNA的应用:
RT-PCR,Northern杂交,cDNA文库建立,mRNA尾端迅速扩增(RACE),差别表达
(DDRT-PCR),引物延长反响(PrimerExtension),体外转录(InVitroRNATranscription),RNA
标志(RNAlabelin
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