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微生物系统的起源和进化 一个多世纪前，达登认为生物来自共同的祖先。现在已经把这个概念画成一棵现代的系统树,在主干的基部,生物的共同祖先并没有具体化,时间大约在35～38亿年前。分子生物学发展得很快,只在前几年,曾对这张图所代表的学说提出了多次的挑战,甚至要将基部的主干改掉。本文将讨论这张图的翻新,以及在各个主要环节上的理论变迁和进步的经过。 1 真核生物的起源和发展 35年前,即20世纪60年代,建立了第一棵现代的生命之树 (universal tree of life)。我们常常可以看到一幅大致分为五界的生物谱系图。这个概念是魏泰克(RH Whittaker)主要根据获得能量的型式而首创并绘制的。该图将生物分为5个界、3个阶(level)。五界指行自养的植物(包括藻类)行异养的真菌、动物(包括单细胞真核原生动物)及细菌和蓝绿藻。三阶:即原核生物、单细胞真核生物及多细胞生物。在原核生物中,又分为两大类,即细菌(bacteria)与蓝细菌(蓝绿藻,cyanobacteria)。这张图代表了1980年以前的认识。 以前的技术水平,对显微镜下的单细胞生物,能提供解决其亲缘关系的信息很少。故而,微生物缺少清晰的种系发生(phylogeny)之树。生命起源于30亿年以前,当时地球的年龄仅十亿多年。在地球的历史中,单细胞生物作为最早的、惟一的居民,生活在长久的地质年代中,约占地球总年龄的1/