用ClustalX做多序列比对分析.docxVIP

用ClustalX做多序列比对剖析 用ClustalX做多序列比对剖析图示 1、翻开程序 如下列图所示： 2、LoadSequnce,载入序列 如下列图所示： fasta格式的文件重点不在于文件名的后缀是什么，而是在于序列的格式。 fasta的格式是： 1、第一行以开头，紧接着序列的说明和描绘。 2、第二行是纯序列atgcg.... 其他序列再起一行，如此下去就能够了。 如： seq1|thisisaexample atgattggaacttgacgt.... seq2|thisisanotherexample ttgagttgaccgtgacgtgag..... 3、选择序列文件，FASTA格式的 如下列图所示： 4、用文本编写器察看FASTA序列文件内容，这里用的是记事本，介绍用EditPlus或许Ultraedit 如下列图所示： 5、序列Load进去之后 如下列图所示： 6、DoCompleteAlignment,往常情况下直接选这个即可，无须改正比对参数 如下列图所示： 7、点DoCompleteAlignment之后弹出的文件对话框，.dnd的是输出的指导树文件，.aln的是序列比对结果，它们都是纯文本文件 如下列图所示： 点“ALIGN”之后开始等待，如果序列不多，很快 就能够算完，如果数据好多，可能要等一段时间，这时候能够用眼睛盯着ClustalX的状态栏，那边会