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内蒙古白绒山羊育种信息管理系统的设计与实现 经过长期的自然选择和人工筛选，内蒙古白鹿羊是一个地方性的优良品种。经过几十年的培育，它积累了非常丰富的繁殖信息。目前,绒山羊育种进展缓慢,管理中存在的问题日益突出:人工管理方法对庞大的育种信息量和数据量的统计汇总已显得力不从心,手工操作不仅费时费力而且准确率低,导致信息处理效率低,信息管理落后;绒山羊平均的生产性能仍然较低,育种的遗传进展较慢。基于此,在对内蒙古白绒山羊育种管理工作进行充分调查的基础上,开发了“内蒙古白绒山羊育种信息管理系统”(以下简称系统),目的是利用计算机储存现有的各种育种信息以代替数据整理的手工操作;规范数据管理方法,对羊场数据进行全面的管理和维护;将这些育种信息利用先进的遗传评价系统进行处理、分析、加工和利用,及时为羊场提供合理的育种方案,用以科学指导绒山羊的育种工作。 1 统计分析与设计 1.1 阿尔巴斯白绒山羊种羊场的生产性能测定 本研究所用材料来自内蒙古鄂托克旗阿尔巴斯白绒山羊种羊场(简称阿白山羊场)1998～2000年的生产性能测定记录和阿白山羊场的系谱记录。 1.2 建立数据表数据库 羊场平时工作中要测定、收集的数据主要有:产羔记录、断乳记录、生产记录、鉴定记录、配种繁殖记录以及羊群保健和畜群周转记录等。根据系统需要并参考生产原表建立如下3个数据库:绒山羊育种信息库、用户数据库和羊场信息数据库。绒山羊育种信息库包含初生羔羊数据表,断乳羔羊数据表,公、母羊产绒数据表和绒纤维测定数据表,配种繁殖数据表,周岁母羊、成年母羊、周岁公羊和成年公羊个体鉴定数据表,出场种羊数据表,以上各数据表在运行时,均以羊号为关键字建立索引,使这些信息既有有机的联系,又便于技术处理。用户数据库包含用户登记表;羊场信息数据库包含种畜场基本情况表和种畜场原表。 1.3 主要育种值 参考高佃平(1999)设计的单性状和两性状动物模型,模型和综合育种值的估计公式如下: 单性状动物模型:yijk=μ+huf8f5瘙厫yuf8f5瘙厫si+ageij+ak+pk+eijk 两性状动物模型:ytijk=μt+huf8f5瘙厫yuf8f5瘙厫sti+agetij+atk+ptk+etijk 两性状综合育种值计算公式:H=W1·a1j+W2·a2j 式中:a1j为第i只绒山羊产绒量的育种值;a2j为该绒山羊体重的BLUP估计值;W1和W2分别是产绒量和产绒后体重的经济加权值。 1.4 基于vfp6.0的对象编码算法 本系统采用WINDOWS环境下的可视化开发工具,结合课题需要,使用Visual FoxPro 6.0(简称VFP6.0)面向对象的程序设计技术,从过去以“过程”为中心思考应用系统开发的结构,变为以“对象”为中心设计模块。VFP6.0是目前微机上最流行的关系数据库语言之一,它具有卓越的数据库处理性能和良好的开发环境。利用VFP6.0的开发环境可方便地设计数据库结构、管理数据库、设计应用程序界面和查询、报表、菜单等,并可利用项目管理器对数据库和程序进行管理,最终生成可执行文件或进行发布。 2 系统应用 2.1 维护后的工作 系统要实现对育种信息的存储、整理、分类、组织、服务、维护等工作。整个系统按照模块的功能划分为系统管理、数据输入、统计查询、育种分析、报表打印和帮助6大部分,系统菜单如图1所示。其中,育种分析是整个系统的核心。 2.2 确定育种值的方法 育种值估计是利用VFP6.0与其它应用程序具有较好接口的功能,调用Meyer编写的MTDFREML(Multiple Trait Derivative Free Restricted Maximum Likelihood)即多性状、非求导约束最大似然法应用软件,根据提示运行MTDFNRM.EXE、MTDFPREP.EXE和MTDFRUN.EXE三个程序得到种畜的估计育种值。其中,MTDFNRM.EXE的功能是求分子血缘系数矩阵及其逆矩阵,MTDFPREP.EXE用于混合模型方程的建立,MTDFRUN.EXE实现方差(协方差)组分及个体育种值估计的计算过程。 2.3 阿白羊场产绒量和产绒后体重遗传值的变化 本系统应用MTDFREML软件可分别计算出产绒量和抓绒后体重的单性状育种值, 并且结合2000年度绒和肉的市场价格计算出产绒量和抓绒后体重的两性状综合育种值,列于表1,同时列出了每只羊的系谱信息。 根据每年的育种值可估计这两个性状在1998～2000年3年间的遗传趋势,遗传趋势是由公羊的加权平均传递力依年份的回归而求得。第p年份公羊的加权平均传递力的计算公式为平均传递力=∑nip·ai/2n.p 式中:nip为第p年中第i只公羊的初产女儿数;ai为第i只公羊的估计传递力;n.p为第p年份内所有公羊的女儿总数。 根据公羊估计传递力计算阿