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用ImageJ来计数细胞的个数的步骤
要把彩色的图像转换成黑白图像。步骤如下:Image→Type→16-bit。
转换成黑白图像后,将要计数的部分用高亮标示出来。步骤如下:Image→Adjust→Threshold。然后拖动鼠标,直到所有的细胞被标示出来。
有时候2个细胞靠得比较紧密,会被计数为1个细胞。这个时候可以采用ImageJ的水洗功能。步骤如下:Image→Binary→Watershed。如下图的蓝色箭头所示,这些是本来计数成一个的细胞,经过水洗之后,更加精确地被计数成了2个细胞。
然后,就可以正式开始分析了。步骤如下:Analyze→AnalyzeParticles。在得出最后的结果之前,还有一些选项需要选择。如果想要计数全部的细胞,那么Size项里面选择“0-infinity”。Circularity的默认值为“0.00-1.00”。一般就取默认值。
最后的结果如下图所示。软件自动测量了每个细胞的大小。这里因为是二维图像,所以就是每个细胞的面积。然后计数了一共有72个细胞,总面积为21286.00,平均大小为295.64。
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