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如何查找质粒图谱

方法一：VectorNT软件

毋庸置疑，这款软件绝对是了解质粒图谱的一个压箱底的法宝，它包含Invitrogen公司里所有的质粒图谱信息和其他比较常见和经典的质粒图谱，可使得初接触分子克隆的小伙伴们对质粒图谱有着简单直观的认识，真正做到了软件在手，质粒我懂。?

方法二：查找质粒图谱的网址

VectorDatabase网址：/vector-database/

直接再输入框中输入pET，即可搜索出相关质粒。

而后点击自己所需要的质粒名称，就可以看到质粒的详细信息以及图谱。

VectorDB网址：/vectordb/vector.html

该网址里对质粒的总结和分类比较完整，基本囊括了所有表达系统的质粒信息。不过，让人有些不爽的是这个网站竟然没有搜索栏，太不人性化了。好在小鱼有妙招：按Ctrl+F，输入质粒名称即可。

点击所需质粒名称即出现以下界面，此时点击sequencelink可查看该质粒的序列，而点击NCBIlink，就可以直接跳转NCBI页面。然后点击右边的sendto，选中File，GeneBank等选项，点击CreateFile选项可得到一个gb格式文件，导入vector软件中，即可得到质粒图谱。

Google学术网址：.hk/

在搜索框中输入质粒名称+map，或者质粒名+sequence+filetype:txt/filetype:pdf，又或者进入Google后，点击图片搜索，直接查找图谱。

悠游博客网址：/5757561.html

如果你能在该网址里找到自己所需的质粒，点击相应的质粒名即可查看质粒图谱。

方法三：公司试剂网页

有些商业化公司整理某一系列的质粒相关信息，如克隆载体pMD18-T，TaKaRa；pGM-T，天根；表达载体Novagen公司的pET系列等。因而如果知道常见的质粒是哪个公司的，去其官方网站上可以查找该质粒的相关信息。

方法四：寻找改造后的质粒图谱

有些经过改造的质粒可先将名称输入Googlescholar中，查看使用过该质粒的文章，进而了解该质粒的来源，因而向文章作者进行咨询。

以文章Kuhlman,T.E.andE.C.Cox(2010).Site-specificchromosomalintegrationoflargesyntheticconstructs.NucleicAcidsRes38(6):e92为例，也可先在PubMed中进行搜索，而后在RelatedInformation中点击Nucleotide，并按照在NCBI下载质粒图谱的方法获取质粒图谱即可。

质粒图谱的绘制Winplas2.7作为质粒绘图的专业软件，文件很小，最主要是简单易学，可在知道或不知道序列的情况下绘制质粒图。接下来，就简单介绍下“白手起家”（不知道序列情况下）时这款软件的使用方法。

点击“文件”菜单中新建命令，出现MapView窗口，同时工具栏中地绘图命令显亮。

点击“插入-空片断”命令，出现一个“创建新质粒”对话框。，在“标题栏”中填入质粒名称,在“碱基对”栏中填入质粒大小,在“类型”单选框中设制质粒图谱为线型还是环形。

点击“确定”后，在MapView窗口就会出现一个圆环，其中有质粒名称及质粒大小。

点击“插入”菜单中“区域”命令，弹出“EditArcObject”对话框。

*在Arc书签中的“碱基对”栏中，填入Arc的起始位置，如209。

*在“长度”栏中填入Arc的长度，如654。在标签栏中填入Arc的名称，如pCMV。

*在ArcStyle书签中，首先确定该Arc是否有箭头以及箭头的方向。分别对应none,5’→3’,3’→5’,及双向。

*通过Width来确定Arc的宽度，也可以调节箭头与Arc径宽度的比值。

*改变填充样式以区分不同的Arc;改变Arc的颜色;同样也可以改变字体的样式、颜色等。

点击OK，则在图谱中209-863bp位置出现一个Arc，名称叫pCMV。

对于任何一个项目，如需要修改，我们只需用鼠标左键选中它（哪里要修点哪里！），并双击，即可出现相应的编辑窗口。对于文字及质粒名称、大小，我们可以用鼠标在任意位置拖放。其它的修饰，点击Edit菜单中“质粒选项”命令,可以调节质粒环的粗细、大小（半径）环的颜色以及背景颜色；标记连线的粗细、颜色以及标出Marker的位置；以及Arc名称连线的粗细、颜色、Arc边缘的颜色等。如此下来，一个质粒图谱就妥妥的出炉啦。

PS：在知道序列结构时绘制质粒图：只需要选择FileNew后，在“插入”菜单选择“GenBank文件”或者“序列文件”，选择一个指定文件，确定后，便根据此序列生成质粒图，进行进一步编辑。当然，在知道序列结构时绘制质粒图时也是可