转录组学研究技术及其应用课件.pptVIP

关于转录组学研究技术及其应用第1页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三一、转录组简介1、概念2、转录组学3、相关知识第2页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三1、概念遗传学中心法则表明,遗传信息在精密的调控下通过信使RNA(mRNA)从DNA传递到蛋白质。因此,mRNA被认为是DNA与蛋白质之间生物信息传递的一个“桥梁”,而所有表达基因的身份以及其转录水平,综合起来被称作转录组(Transcriptome)。转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA)。第3页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三2、转录组学研究生物细胞中转录组的发生和变化规律的科学就称为转录组(transcriptomics)。转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。第4页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三3、相关知识（1）四大组学基因组转录组蛋白质组代谢组解释人类生老病死奥秘的四大组学第5页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三（2）基因组学基因组学（英文genomics），研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。用于概括涉及基因作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学分支。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物，医学，和工业领域的重大问题。第6页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三1基因组发展趋势图第7页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三（3）蛋白质组学第8页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三蛋白质组学（proteome）一词，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的杂合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识，这个概念最早是在1995年提出的。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径第9页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三（4）代谢组学代谢组学(metabonomics／metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。其研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。第10页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三代谢组学研究进展第11页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三二、主要技术及其原理1、基因芯片技术(Microarray)2、基因表达系列分析技术(Serialanalysisofgeneexpression，SAGE)3、大规模平行测序技术(Massivelyparallelsignaturesequencing，MPSS)4、RNA测序技术(RNAsequencing，RNA-seq)。第12页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三1、基因芯片技术(Microarray)在转录组研究中应用最早及最广泛的为基因芯片技术(Microarray)，首先从待检测样品中提取RNA，并利用荧光标记的核苷酸将其反转录成cDNA，经过标记的核苷酸序列可与基因芯片特定位点上的探针杂交，经检测杂交信号而获取细胞基因表达信息。第13页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三基因芯片原理图第14页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三2、基因表达系列分析技术(SAGE)基因表达系列分析技术技术是一种基于测序技术、开放式的、快速高效的分析细胞基因表达状态的方法，该技术不需任何基因序列的信息，能够全局性地检测所有基因的表达水平。第15页，讲稿共32页，2023年5月2日，星期三3、大规模平行测序技术(MPSS)MPSS技术是对SAGE技术的改进，但其原理都是基于短标签测序(Tag-basedsequencing)的方法。MPSS技术可获得更长的短标签，因而精度更高；此外，MPSS技术特有的