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基于体内ADME过程和网络药理学的中药现代研究思路

编者按：网络药理学作为新兴学科，成为药物研究的新模式。中

医药整体性、系统性、复杂性的特点，使其亟待寻求中医药创新研究

的新方法。因此，将网络药理学与中医药有机结合，已经成为现代医

药学具有原创价值的研究方向。

值此世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会第二届学术年

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基于体内ADME过程和网络药理学的中药现代研究思路

许海玉，黄璐琦，卢鹏，杨洪军*

111，21

（1.中国中医科学院中药研究所

2.中国科学院自动化研究所）

中药是复杂化学体系，中药的疗效是中药的化学物质作用于人体，

使机体的生理机能或生化反应发生变化的复杂过程。一般认为，中药

具有“多成分、多靶点、低亲和力、低选择性”作用特点，如何用现

代语言阐释中药的药效物质基础和作用机制一直是研究的难点和关键

点。近年来，网络药理学是通过网络方法来分析药物、靶点和疾病之

间的相互关系，已经逐步取代了以往单一“基因-疾病-药物”的传统

新药研发思想。目前网络药理学已经成为新药研发理论方法的一个研

究热点，并且受到中医药学者的高度关注，积极探索网络药理学的技

术和方法应用到中药研究。但是，笔者认为，中药网络药理学必须结

合中药本身的特点，加强中药体内ADME过程研究，明确中药的入血

成分及其达靶成分.然后通过网络药理学阐释其药理作用及其作用机制，

从而用现代技术诠释中药的药效物质基础及其作用特点。

1网络药理学的概况

在过去的10多年中.新药研发的失败率不断增高，面临困境，这不

是技术问题，而是哲学问题，与疾病相关单靶点高选择性药物设计的

主导思想是同时发生的。随着现代生命科学技术的发展，人类对疾病

的生物学本质认识不断深化，西方医药界逐渐认识到多基因、多环境

因素及其相互作用引起的复杂性疾病。2007年，AndrewLHopkins

提出了网络药理学，将成为新药研发领域里新的发展方向。网络药理

学是在系统生物学和多向药理学快速发展的基础上建立起来的，它是

在生物网络中各生物实体（疾病、表型、基因、靶标、药物等）相互

作用的基础上，通过系统分析方法，观察药物对生物网络的作用和影

响，使药物的研发更能针对疾病的实际情况，提高研发成功率。

网络药理学理解复杂的生物系统不仅仅需要实验，同样也需要计

算方式的支撑。计算方法能够使网络药理学在复杂生物相互作用网络

中获取整体、机制性信息，并能够发现新药靶标以及特效药的组合。

尽管在网络药理学中的计算方法还处于实用建模和理论探索阶段，但

是它已经为制药业面临的关键科学问题提供了一个很好的基础。网络

药理学概念出现比较晚，但是其内涵已经在药理学实际应用中出现，

作者概括了药物靶标识别、疾病关联基因发现等方面的研究，总结其

方法主要有5个类型的计算方法：网络拓扑分析、靶标准则分析、分

类分析、聚类分析和回归模型分析。

网络药理学采用文本数据挖掘（textmining）、知识发现

（knowledgediscoveryofdatabase，KDD）网络分析（network

analysis）等技术探索生物实体之间潜在的未被发现的关系，如构建疾

病靶标的二部图网络，其中节（顶）点（vertex）代表疾病或靶标，

边（edge）代表节点间的相互作用关系，即若2个节点以边相连，则

其具有某种特定的关系，反之，则认为无相互作用或潜在未被发现关

系。这种靶标网络体系具有评价疾病的发生发展状态，药物对疾病靶

标网络的干预与影响预测等功能。网络药理学多以生物学数据库为处

理对象，如在蛋白质相关的HPRD，BIND，DIP等；与遗传、性状及

其基因相关的OMIM；药物研发方面的Drug