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ICS67.120.30
B50
DB22
吉林省地
方标准
DB22/T1978—2013
野鲤种质鉴定微卫星法
IdentificationSpecificationsofWildCarpMicrosatellitesMethod
吉林省质量技术监督局
发布
DB22/T1978—2013
前
言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2001给出的规则起草。
本标准由吉林省水利厅提出并归口。
本标准起草单位:吉林省水产科学研究院。
本标准主要起草人:郑伟、闫春梅、毛瑞鑫、陈伟强、王战蔚、王文兰、杜晓燕、李忠强、李秀颖、
常淑芳、李永利。
I
DB22/T1978—2013
野鲤种质鉴定微卫星法
1范围
本标准规定了利用微卫星法进行野鲤种质鉴定技术的试验方法。
本标准适用于鲜活野鲤种质鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
又称短串联重复序列或简单重复序列(shorttandemrepeats,STRs;simplerepeats,SSRs),以2bp~
6bp的短核苷酸序列为基本单位,呈串联重复状散在分布于生物体基因组中。
衡量群体间若干性状综合遗传差异大小的指标。按多元统计分析方法计算品种间多个性状基因型值
构成的多维空间的几何距离,就叫作群体间的遗传距离。主要的遗传距离分析方法有:Nei氏标准遗传
距离(Nei’sstandardgeneticdistance)。
微卫星由核心序列和两侧的侧翼序列所构成,侧翼序列使微卫星特异地定位于染色体某一部位,核
心序列重复数的差异则形成微卫星高度的多态性。若某个体基因组中某个微卫星重复单位数相等,该个
体在该座位的基因型为纯合子,否则为杂合子。检测方法是针对微卫星两端的侧翼序列设计引物,对模
板DNA进行PCR扩增,根据结果判断个体基因型,进行统计分析。
5.1除非另有说明,所用试剂均为分析纯。实验用水应符合GB/T6682一级水的要求。
1
DB22/T1978—2013
5.2无水乙醇。
5.3N,N,N′,N′—四甲基乙二胺(TEMED):4℃保存。
5.4TaqDNA聚合酶:-20℃保存。
5.5分子量标准(Markers):DL2000。
5.6溴化乙锭(EB)。
5.7琼脂糖。
5.8Tris饱和酚。
5.9300g/L丙烯酰胺溶液:20mL水中融解29g丙烯酰胺,1g甲叉双丙烯酰胺,定容至100mL,4℃
保存。
5.105×Tris硼酸(5×TBE)电泳缓冲液:Tris27g,硼酸13.75g,加蒸馏水400mL溶解后,加入0.5
mol/LEDTA(pH8.0)10mL,补充蒸馏水定容至500mL。
5.11100g/L过硫酸铵:8mL水中溶解1g过硫酸铵,加水至10mL,4℃保存,现用现配。
5.121g/L硝酸银(AgNO3)染色液:将AgNO30.5g溶于超纯水450mL,加ddH2O定容至500mL,
棕色瓶中保存。
5.13裂解液:5g/L十二烷基肌胺酸钠,10mmol/LEDTA(pH8.0),200μg/mL蛋白酶K。
5.14显色液:将NaOH10g,无水Na2CO30.2g,甲醛2mL,溶解于适量蒸馏水中,并定容至500mL,
现用现配。
5.15提取液:Tris饱和酚+氯仿+异戊醇(25+24+1,体积比)。
5.16乙醇溶液:乙醇+水(7+3,体积比)。
5.17dNTP:四种脱氧核苷酸(4×dNTP);保存条件为-20℃±2℃。
5.18阳性对照品:30尾野鲤DNA提取物,用TE(pH8.0)溶解至50ng/μL,4℃保存备用。
5.19阴性对照品:30尾建鲤DNA提取物,用TE(pH8.0)溶解至50ng/μL,4℃保存备用。
5.20微卫星引物:参见附录A。
6.8凝胶成像分析系统。
用于试验的鲜活鲤鱼样本数量至少30尾。
7.2试样制备
2
DB22/T1978—2013
8试验步骤
8.1DNA提取
取20mg鳍条加入0.6mL裂解液,55℃温育1-2h
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