- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
免疫相关基因对头颈部鳞状细胞癌患者预后的影响
[摘要]目的通过生物信息学方法对头颈部鳞状细胞癌(headandnecksquamouscellcarcinoma,HNSCC)患者的基因表达进行分析,寻找影响HNSCC患者预后的免疫相关基因,探索HNSCC新的治疗靶点。方法本研究基于癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)和基因表达综合数据库,下载HNSCC和非肿瘤组织样本的RNA测序数据。分别对两数据库样本进行差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析,筛选免疫相关基因。采用单因素Cox回归、Lasso回归和多因素Cox回归分析识别出与HNSCC预后显著相关的基因,并以此为基础计算每个TCGA样本的风险评分,构建相关预后模型。根据风险评分中位数将样本分为高、低风险组;对高、低风险组进行基因差异表达分析,揭示不同免疫状态下的基因表达变化,并对差异基因进行通路富集分析。结果筛选发现MS4A1、IL12RB2、DMBT1、LTF是影响HNSCC患者预后的免疫相关基因。其中MS4A1和IL12RB2在HNSCC中高表达,DMBT1和LTF低表达。HNSCC死亡组的风险评分显著高于生存组。风险评分可作为HNSCC的独立预后指标。高、低风险组差异基因显著富集于免疫应答调节细胞表面受体信号通路。结论MS4A1、IL12RB2、DMBT1、LTF可用于HNSCC的风险评估、疾病监测和疗效评估。免疫反应在HNSCC患者的预后中至关重要,进一步的研究有望推动新治疗策略的开发。
[关键词]头颈部鳞状细胞癌;免疫;预后;生物信息学
[中图分类号]R653;R739.91[文献标识码]A[DOI]10.3969/j.issn.1673-9701.2025.07.009
Effectofimmune-relatedgenesintheprognosisofpatientswithheadandnecksquamouscarcinoma
SHIChenxue1,XUMin2,XUYuxin1,WANGJian3,WUZhenhua1
1.DepartmentofOtolaryngology,HeadandNeckSurgery,AffiliatedLihuiliHospitalofNingboUniversity,Ningbo315000,Zhejiang,China;2.DepartmentofNeurology,theAffiliatedHospitalofXuzhouMedicalUniversity,Xuzhou221006,Jiangsu,China;3.DepartmentofOtolaryngology,HeadandNeckSurgery,theAffiliatedPeople’sHospitalofNingboUniversity,Ningbo315040,Zhejiang,China
[Abstract]ObjectiveToanalyzethegeneexpressionofpatientswithheadandnecksquamouscellcarcinoma(HNSCC)usingbioinformaticsmethods,identifyingimmune-relatedgenesthatimpactprognosisandexploringnewtherapeutictargetsforHNSCC.MethodsThisstudywasbasedonTheCancerGenomeAtlas(TCGA)andGeneExpressionOmnibusdatabasetodownloadRNAsequencingdatafromHNSCCandnon-tumortissuesamples.Differentialexpressiongeneanalysisandweightedgeneco-expressionnetworkanalysiswereperformedrespectivelytoscreenimmune-relatedgenes.UnivariateCoxregression,LassoregressionandmultifactorCoxregressionanalyseswereusedtoidentifythegenessignificantlynbsp;associatedwithHNSCCprognosis,andonthisbasis,theriskscoreofeachTCGAsamplewascalculatedandthecorrelationprognosismodelwasconstructed.Thesamplewasdividedintohighandlowrisk
文档评论(0)