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—242—江苏农业科学2025年第53卷第4期
孙明慧,刘丹丹,吴琼,等.茶树BURP基因家族全基因组鉴定与表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(4):242-253.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2025.04.029
茶树BURP基因家族全基因组鉴定与表达分析
孙明慧,刘丹丹,吴琼,焦小雨,王文杰
(安徽省农业科学院茶叶研究所,安徽合肥230001)
摘要:茶[Camelliasinensis(L.)Kuntze]因其极高的营养价值和经济重要性而在全球范围内种植。为了研究茶树
中BURP的作用,基于茶树全基因组对茶树中BURP基因家族进行筛选和鉴定。通过TBtools查找筛选包含有
PF03181结构域的序列,使用生物信息学对其编码的蛋白质进行染色体定位、系统进化关系、蛋白质理化性质和共线
性关系等分析。基于转录组数据挑选对胁迫响应较强烈的基因4个,即CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和
CsBURP15,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-timefluorescentquantitativePCR,qPCR)方法检测其在冷、盐和干
旱胁迫下的表达情况。利用茶树基因组数据鉴定出17个BURP基因,聚类为3个亚组,其中PG1-like包含5条,
β
BNM2-like包含8条,RD22-like包含4条。结构域预测发现只有11条基因包含完整的BURP结构域,6条序列只
包含其中的1或2个motif,而CsBURP1不包含这3个motif。CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和CsBURP15均响应干
旱胁迫、冷胁迫和盐胁迫。CsBURP7响应最剧烈,在低温处理下为负调控,保持在初始表达量的1/3左右,干旱处理则
为正调控,12h时为初始值的6倍。CsBURP家族对低温胁迫、盐胁迫和干旱胁迫均有响应,推测其在茶树抗逆中发挥
重要作用。
关键词:BURP基因家族;茶树;基因表达;非生物胁迫;全基因组鉴定
中图分类号:S188;S571.101文献标志码:A文章编号:1002-1302(2025)04-0242-11
BURP是植物界特有的一类在响应植物胁迫、组。除此之外,还有在水稻中新发现的BURPV、
[5]
参与种子和花药发育、物质代谢中起到重要作用的BURPV和BURPV家族,后续又在玉米和高粱
ⅠⅡ
中发现[6]
蛋白质。BURP可大致分为4个亚科,包括油菜的BURP亚家族。BURP基因家族的蛋白
Ⅷ
一种小孢子蛋白BNM2(Brassicanapusmicrospore均包含1个保守的BURP结构域,即4个连续的CH
[1]残基,可用CH—X—CH—X—CH—X—
protein2),蚕豆的一种未知种子蛋白USP1025-2725-26
[2]CH通式表示,其中X可以代表任何氨基酸。这些
(unknownseedproteinfromfababean),拟南芥中
的脱水反应蛋白RD22(responsivetodehy-dration亚组分别具有各自的结构特征,比如RD22-like蛋
[3]白和PG1-like含有一个额外的富含
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