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基于SSR标记的小麦新种质抗条锈基因定位与分子作图研究
一、引言
1.1研究背景与意义
小麦(TriticumaestivumL.)作为全球最重要的粮食作物之一,为人类提供了约20%的能量摄入,在保障粮食安全方面发挥着不可替代的关键作用。然而,小麦的生产常受到多种病害的严重威胁,其中小麦条锈病(Wheatstriperust)是影响最为严重的病害之一,素有“小麦癌症”之称。
小麦条锈病是由条形柄锈菌小麦专化型(Pucciniastriiformisf.sp.tritici)引起的一种具有高传播性和强破坏性的气传真菌病害。该病菌平均每5年就会产生一个新的优势小种,其流行速度快、发生区域广,可借助高空气流实现远距离传播,这使得小麦条锈病的防控成为世界性难题。在我国,小麦条锈病的发生尤为频繁且危害严重,我国是世界上小麦条锈病发生面积最大、危害损失最重的国家之一,2020年,小麦条锈病被农业农村部列入《一类农作物病虫害名录》。从苗期到成熟期,小麦在整个生育期都可能遭受小麦条锈菌的侵害,进而导致生长发育受到多方面的负面影响,最终造成产量损失。在一般流行年份,小麦条锈病常引起5%-10%的减产;在个别流行年份,减产幅度可达25%;而在发病严重的田块,减产甚至可超过60%,乃至颗粒无收。除了产量的损失,小麦条锈病还会显著降低小麦的品质,使麦粒的营养成分和加工品质受损,进而降低其市场价值和经济收益。
长期以来,防治小麦条锈病主要依赖化学药剂,但这种方法不仅成本高昂,还会对环境造成污染,导致病原菌产生抗药性,同时也会对非靶标生物产生负面影响。因此,培育和利用抗病品种被公认为是防治小麦条锈病最经济、有效且安全的措施。而寻找和挖掘新的抗条锈基因则是培育抗病品种的基础和关键,只有不断发掘新的抗条锈基因,才能为小麦抗病育种提供丰富的基因资源,从而培育出具有持久抗性的小麦新品种。
在小麦抗条锈病育种中,准确地定位和克隆抗条锈基因至关重要。通过对这些基因的定位和克隆,可以深入了解小麦抗条锈病的分子机制,为小麦抗病育种提供坚实的理论基础。同时,利用分子标记技术对这些基因进行标记和追踪,能够显著提高育种效率,加快抗病品种的选育进程。简单序列重复(SimpleSequenceRepeat,SSR)标记作为一种高效、可靠的分子标记技术,具有多态性高、共显性遗传、重复性好、操作简便等优点,在小麦抗条锈基因的定位和分子作图研究中得到了广泛应用。
本研究以特定的小麦新种质为材料,旨在利用SSR标记技术对其抗条锈基因进行精确的定位和分子作图。这一研究不仅有助于深入揭示小麦抗条锈病的遗传机制,丰富小麦抗条锈病的理论研究,还能够为小麦抗病育种提供重要的基因资源和有效的分子标记,从而加快小麦抗病品种的选育进程,提高小麦的产量和品质,对于保障我国乃至全球的粮食安全具有重要的现实意义。
1.2国内外研究现状
小麦抗条锈病基因的研究一直是植物病理学和遗传育种学领域的研究热点。国内外众多科研团队在该领域开展了大量的研究工作,取得了一系列重要的研究成果。
在抗条锈病基因的发掘与鉴定方面,经过长期的努力,目前已鉴定出大量的小麦抗条锈病基因。截至目前,已正式命名的小麦抗条锈病基因超过80个,这些基因在小麦基因组中分布于不同的染色体上,为小麦抗条锈病育种提供了丰富的基因资源。例如,Yr1、Yr9、Yr26等基因在小麦抗条锈病育种中发挥了重要作用,育种家利用这些基因培育出了多个抗病品种,在一定时期内有效地控制了小麦条锈病的危害。然而,由于小麦条锈病菌生理小种复杂多变,新的毒性小种不断出现,导致许多已利用的抗条锈基因逐渐丧失抗性,使得小麦抗病品种的抗性频繁丧失,病害再次暴发流行。因此,持续发掘新的抗条锈基因成为小麦抗条锈病研究的重要任务。
在分子标记技术应用于小麦抗条锈病基因研究方面,随着分子生物学技术的飞速发展,各种分子标记技术如限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、简单序列重复(SSR)、单核苷酸多态性(SNP)等相继出现,并广泛应用于小麦抗条锈病基因的定位、克隆和分子作图研究中。其中,SSR标记以其独特的优势成为目前小麦抗条锈病基因研究中应用最为广泛的分子标记技术之一。
SSR标记技术自20世纪90年代初问世以来,在作物遗传育种领域得到了迅速发展和广泛应用。在小麦抗条锈病基因的研究中,SSR标记主要用于筛选与抗条锈基因紧密连锁的分子标记,进而实现对这些基因的精确定位和分子作图。通过SSR标记分析,可以确定抗条锈基因在小麦染色体上的具体位置,明确其与其他基因之间的连锁关系,为基因的克隆和功能研究奠定基础。例如,一些研究利用SSR标记成功定位了多个
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