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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种高通量测序技术基于“边合成边测序”原理?
A.纳米孔测序(Nanopore)
B.Illumina测序
C.IonTorrent测序
D.454焦磷酸测序
答案:B
解析:Illumina测序技术通过桥式PCR扩增DNA簇,利用荧光标记的脱氧核苷酸进行边合成边测序,是目前最主流的短读长测序技术。A选项纳米孔测序基于电流变化检测碱基;C选项IonTorrent通过检测H?释放(半导体测序);D选项454通过焦磷酸发光检测,均不符合“边合成边测序”原理。
以下哪种变异类型属于小插入缺失(Indel)?
A.单碱基替换(C→T)
B.3个碱基的插入
C.染色体易位(t(9;22))
D.拷贝数变异(CNV)
答案:B
解析:小插入缺失(Indel)指长度≤50bp的DNA片段插入或缺失。A为单核苷酸变异(SNV);C为染色体结构变异;D为较大片段的拷贝数变化(通常>50bp),均不属于Indel。
基因数据解读中,用于评估变异致病性的核心数据库是?
A.dbSNP
B.gnomAD
C.ClinVar
D.Ensembl
答案:C
解析:ClinVar是NCBI维护的变异致病性数据库,整合了临床实验室、研究机构的致病性分类(如良性、致病),是解读的核心依据。A(dbSNP)主要记录变异位置;B(gnomAD)提供群体频率;D(Ensembl)是基因组注释数据库,均不直接评估致病性。
基因测序数据质量控制中,Q30表示?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.测序错误率≤1%的碱基比例
C.测序读长≥30bp的比例
D.GC含量偏差≤30%
答案:A
解析:Q值计算公式为Q=-10×log??(错误率),Q30对应错误率10?3(0.1%),Q30比例是评估测序质量的核心指标。B对应Q20(错误率1%);C是读长指标;D是GC偏差指标。
以下哪个工具常用于基因变异的功能注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.SAMtools
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可注释变异的基因组位置、功能影响(如错义突变)、群体频率等。A(GATK)用于变异检测;C(BWA)用于序列比对;D(SAMtools)用于处理比对文件,均不直接注释功能。
连锁不平衡(LD)在基因数据解读中的主要应用是?
A.评估测序数据的覆盖均匀性
B.推断单倍型或标记关联变异
C.计算群体杂合度
D.预测蛋白质三维结构
答案:B
解析:连锁不平衡指染色体上相邻位点的等位基因非随机关联,可用于推断单倍型(如通过标签SNP代表一组LD区域的变异)或关联分析(如GWAS中标记与致病位点的关联)。A是测序质量指标;C是群体遗传学参数;D需结构预测工具(如AlphaFold)。
符合孟德尔隐性遗传的疾病,患者父母的基因型最可能是?
A.父母均为显性纯合(AA×AA)
B.父母一方显性纯合(AA),一方隐性纯合(aa)
C.父母均为杂合(Aa×Aa)
D.父母一方杂合(Aa),一方隐性纯合(aa)
答案:C
解析:隐性遗传病需患者为隐性纯合(aa),父母需各提供一个a等位基因,因此父母最可能均为杂合(Aa×Aa),子女有25%概率为aa。A不可能生出aa;B子女为Aa(显性表型);D子女50%为aa(患者),但非“最可能”(隐性遗传病携带者更常见杂合)。
转录组测序(RNA-seq)数据解读中,差异表达基因(DEG)的筛选通常不依赖以下哪个指标?
A.FPKM/RPKM
B.P值(统计显著性)
C.倍变化(FoldChange)
D.拷贝数变异(CNV)
答案:D
解析:RNA-seq通过表达量(FPKM/RPKM)评估基因转录水平,差异表达筛选需结合统计显著性(如P值)和倍变化(如|log2FC|≥1)。CNV是DNA水平的结构变异,与RNA表达量无直接关联(除非CNV影响基因剂量)。
基因数据解读的伦理规范中,“知情同意”的核心要求是?
A.受试者需签署纸质同意书
B.受试者完全理解所有技术细节
C.明确告知数据用途、风险及隐私保护措施
D.数据仅用于科研,不得商业化
答案:C
解析:伦理规范要求知情同意需明确告知受试者数据的使用范围、潜在风险(如隐私泄露)、隐私保护措施(如去标识化),而非要求受试者掌握技术细节(B错误)。A是形式要求,非核心;D过于绝对(部分伦理允许有限商业化)。
评估变异是否为“人群罕见”时,通常参考的群体频率阈值是?
A.>5%
B.<1%
C.>10%
D.<0.1%
答案:B
解析:根据ACMG(美国医学遗传学学会)指南,致病性变异通常要求在群体数据
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