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肠道微生物与结石的形成2026

?肾结石是一种复杂的且全球流行的疾病,受基因和环境因素的影响。成对的研究显示结石的遗传风险大概为56%,然而其他的影响风险包括:饮食、运动、工作环境和地理。最近这些年,肠道微生物体系影响尿液组成的作用也导致了有数据显示:它们也会影响肾结石的发生率。大约75%的肾结石主要由草酸钙构成,尿草酸被认为是一个重要风险因素。微生物体系在肾结石的形成机制和预防都有重要作用,肠道微生物体系在肾脏疾病的作用是最近的研究热点。草酸杆菌属可减少肠道内的草酸盐,并减少尿液中草酸排泄。

????肠道微生物指动物肠道中存在的数量庞大的微生物,这群微生物依靠动物的肠道生活,同时帮助寄主完成多种生理生化功能。肠道不仅是人体消化吸收的重要场所,同时也是最大的免疫器官,在维持正常免疫防御功能中发挥着极其重要的作用。人体肠道为微生物提供了良好的栖息环境,成人肠道内的微生物数量高达10^14个,接近人体体细胞数量的10倍;质量达到1.2kg,接近人体肝脏的质量;其包含的基因数目约是人体自身的100倍,具有人体自身不具备的代谢功能。微生物体系在功能上,在人体宿主细胞中进行各种生物加工。越来越多的人担心“西式”饮食和生活方式已经改变了肠道微生物体系的基因组成和新陈代谢活动。这些细菌总体的改变与一些疾病不断提高的发病率有关:肥胖、冠状动脉疾病、过敏和代谢综合征。这些影响使得肠道微生物体系也影响与肾结石形成相关的溶质的吸收和分泌这一假设成为可能。

到目前为止,关于肠道微生物体系在肾结石的发病机制中的作用知之甚少。最近有一项研究发现了肾结石患者与对照组的肠道微生物体系有显著差异。两组患者的粪便和尿液样本显示有178类菌群属,其中每组中五种最丰富的肠型或不同的细菌群落构成了所鉴定的细菌丰度50%以上。普氏菌属在对照组中含量最丰富,拟杆菌属在肾结石患者组中含量最丰富。?真菌与草酸水平呈负相关,埃希菌属与柠檬酸盐水平呈负相关。结石患者和对照组的细菌丰度差异是导致结石形成的主要因素还是次要因素,就像抗生素使用和饮食的作用一样始终不确定。如此广泛的肠道微生物体系的特性需要更多的研究。

一、基因和微生物特性:

Allison及其同事于1985年发现了一种草酸降解菌Oxalobacterformigenes(Oxf),因其参与草酸钙结石病而备受关注。临床研究提示:机体缺失Oxf与高草酸尿症与草酸结石形成间有直接联系。革兰氏阴性厌氧菌是人类肠道菌群和其他哺乳类动物的正常细菌的一部分。它的独特之处在于它既需要草酸作为碳源也需要ATP的生成。它已经在人类、啮齿动物、狗、猪和牛的肠道被发现。如果存在的话,那么它可降解摄入的草酸,减少肠道吸收,减少刺激结肠草酸分泌,预防高草酸尿。

Oxf的草酸盐代谢需要通过被oxIT基因编码的称为OxlT的膜转运蛋白摄取细胞外草酸盐以换取甲酸盐(参见图1)。frc基因编码甲酰CoA转移酶Frc,其通过添加辅酶A分子以形成草酰-CoA来活化草酸盐。然后将草酰基-CoA脱羧成CO2和甲酸盐,然后用oxlT利用后者以吸收更多的草酸盐。脱羧反应由oxalyl-CoA-脱羧酶催化,由oxc基因编码。质子的向内梯度导致ATP产生。

虽然oxf被认为是最有效的草酸盐降解剂,但其他草酸盐降解微生物群在人体肠道中的作用尚未完全阐明。多种细菌种类同时具有oxc和frc,并且在体外具有草酸盐降解活性。最近,Hatch等人研究表明:乳酸双歧杆菌定殖通过降解膳食草酸盐并减少其在小鼠模型中的肠道吸收来减少尿草酸盐。在一项针对南非男性的研究中,已经确定了乳酸杆菌属具有降解高草酸盐能力。

比较17种Oxf的细胞脂肪酸谱将这些菌株分成两个主要组,目前称为第1组(例如菌株OXCC13)和第2组(例如菌株HOxBLS)。作为人类微生物组计划的一部分,这两个菌株的基因组测序可以增加我们对生物体重要生物学特性的理解。在对数和静止生长期培养物中进行Oxf的额外蛋白质组学分析,可以鉴定对其生长和存活至关重要的特定蛋白质。

基于PCR检测对oxc?和/或?frc基因的特异性发展,允许研究该生物体在草酸盐代谢中的作用。可以高度灵敏和特异性地快速检测粪便培养物和新鲜粪便标本中的Oxf。?测量粪便的草酸盐降解能力是间接确定有机体存在与否和活性的另一种方法。

研究报道了Oxf在正常人体肠道中定殖的程度有很大差异。可能存在检测不到的细菌水平,或者每克粪便可能存在多达107个细菌。?粪便样品中的Oxf水平增加约10倍,饮食草酸盐增加10倍。相比之下,有机体的丰度随着钙摄入量的增加而降低,这会使草酸盐结合并降低其可用性。

我们最近描述了人类微生物组计划(HMP)数据揭示的人体肠道微生物组中Oxf的流行,相对丰度和稳定性[15]。使用全基因组枪(WGS)测序和V13或V3516SrR

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