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生物标志化合物指南（第2版）

生物标志化合物是指在生物体内或地质体中由生物合成、经一定地质作用或生物代谢过程保留下来的具有特定分子结构的有机化合物，其分子骨架和立体构型能够反映原始生物来源、沉积环境、热演化程度或生物代谢状态等关键信息。作为连接生物与地质、生命科学与地球科学的重要桥梁，生物标志化合物的研究在油气勘探、古环境重建、疾病诊断及环境监测等领域发挥着不可替代的作用。随着分析技术的进步与研究维度的拓展，第二版指南在保留经典理论的基础上，重点强化了高分辨质谱技术应用、多源数据融合及新型标志物开发等内容，旨在为研究者提供更系统、更前沿的技术指导。

一、基础理论与分类体系

生物标志化合物的核心特征在于其“生物继承性”，即分子结构中保留了原始生物合成途径的信息。根据生源母质、演化阶段及功能属性，可将其分为三大类：

1.生源类生物标志化合物：直接来源于活体生物的代谢产物或结构组分，分子结构与原始生物合成产物高度相似。例如，光合生物产生的类异戊二烯类化合物（如植烷、姥鲛烷）是叶绿素侧链植醇的降解产物，其分布特征可指示原始生物群落类型；甾醇（如胆固醇、麦角甾醇）在生物膜中起结构稳定作用，经成岩作用转化为甾烷后，C27-C29甾烷的相对丰度可用于区分藻类（C27为主）、高等植物（C29为主）等生源输入。

2.成岩类生物标志化合物：指在沉积成岩过程中经脱水、环化、异构化等地质作用形成的衍生物，其分子结构与原始生物标志物存在一定差异，但仍保留生源信息。典型代表为藿烷类化合物，其前体是细菌细胞膜中的藿类脂，经成岩作用转化为17α(H)-藿烷、22R/S型藿烷等同系物。22S/(22S+22R)比值随埋深增加而升高，可用于判断沉积岩的成岩阶段。

3.热演化类生物标志化合物：在高温高压条件下发生芳构化、去甲基化或碳骨架重排的产物，其分子构型变化与热成熟度直接相关。例如，甲基菲指数（MPI-1）通过计算1-甲基菲、2-甲基菲与9-甲基菲的相对丰度，可定量表征烃源岩的成熟度；而规则甾烷的ααα20R/ααα20R+ββ20R比值（C29甾烷异构化参数）随成熟度升高从0.2逐渐趋近于0.5，是判断油气生成阶段的经典指标。

二、分析流程与技术要点

生物标志化合物的分析需遵循“样品采集-前处理-仪器检测-数据解析”的全流程质量控制，任一环节的偏差均可能导致结果失真。

1.样品采集与保存

样品的代表性是分析结果可靠性的基础。对于地质样品（如岩芯、沉积物），需按层位连续取样，避免风化或污染；对于生物样品（如血液、组织），应采用无菌操作，低温（-80℃）保存以防止代谢物降解。特别注意，石油及烃源岩样品需用铝箔或玻璃容器密封，避免轻烃组分挥发；现代沉积物样品需在无氧条件下冷冻，防止氧化导致的分子结构破坏。

2.前处理技术

前处理的核心目标是将生物标志化合物从复杂基质中分离并富集，同时去除干扰物质。常用方法包括：

-溶剂萃取：采用二氯甲烷/甲醇（9:1）混合溶剂索氏提取，可有效提取非极性至弱极性的生物标志化合物；对于极性较强的代谢标志物（如胆汁酸），需用甲醇/水（7:3）提取并结合固相萃取（SPE）纯化。

-柱层析分离：利用硅胶/氧化铝柱将提取物分为饱和烃、芳烃、非烃和沥青质四组分，其中饱和烃组分富含类异戊二烯、甾萜烷，芳烃组分含芳构化甾萜类及多环芳烃（PAHs）。

-衍生化处理：针对含羟基、羧基的化合物（如甾醇、脂肪酸），需通过硅烷化（如BSTFA试剂）或甲基化（如重氮甲烷）反应提高挥发性，以适配气相色谱（GC）检测。

3.仪器检测与数据获取

现代分析技术的进步显著提升了生物标志化合物的检测灵敏度与结构解析能力：

-气相色谱-质谱联用（GC-MS）：仍是最经典的手段，通过保留时间（反映沸点与极性）和质谱碎片（反映分子结构）实现定性，选择离子扫描（SIM）模式可提高痕量组分的检测限（通常达ng/g级）。例如，检测C27-C35藿烷时，选择m/z191特征离子扫描，可有效排除其他组分干扰。

-气相色谱-同位素质谱（GC-IRMS）：通过测定碳同位素（δ13C）或氢同位素（δD）组成，可追溯生物标志化合物的生源（如C3植物与C4植物的δ13C差异约为10‰）或形成环境（如沉积水介质盐度影响δD值）。

-高分辨质谱（HRMS）：如飞行时间质谱（TOF-MS）或轨道阱质谱（Orbitrap-MS），其质量分辨率（100,000）可区分分子式相近的异构体（如C20H36与C19H32O的质量差仅0.036Da），结合数据库（如NIST、LipidMaps）可实现未知标志物的快速鉴定。

4.数据解析与验证

数据解析需结合生物合成路径、地质演化规律及统计方法：

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