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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
高通量测序(NGS)的核心技术原理是?
A.链终止法(Sanger测序)
B.边合成边测序(SequencingbySynthesis)
C.纳米孔电流信号检测(纳米孔测序)
D.微阵列杂交(基因芯片技术)
答案:B
解析:NGS的核心原理是边合成边测序(如Illumina平台),通过dNTP携带的荧光标记实时读取序列;A是一代测序技术;C是三代测序(长读长);D是杂交捕获技术,非测序原理。
以下哪项是ClinVar数据库的主要功能?
A.存储人类基因组参考序列(GRCh38)
B.收集变异的临床意义(致病性/良性)
C.提供基因表达谱数据(RNA-seq)
D.分析蛋白质三维结构(AlphaFold)
答案:B
解析:ClinVar是NCBI维护的变异临床意义数据库,记录变异与疾病的关联证据;A是GenBank/GRCh38的功能;C是GEO数据库;D是结构预测工具。
基因数据质量控制中,“Q30”指标指的是?
A.测序深度≥30X的碱基比例
B.碱基识别错误率≤0.1%的碱基比例
C.比对到参考基因组的reads比例≥30%
D.杂合子检出率≥30%
答案:B
解析:Q30表示碱基质量值≥30,对应错误率≤0.1%(10?3);A是测序深度指标;C是比对率;D是基因型质量指标。
以下哪种变异属于“意义未明的变异(VUS)”?
A.已明确与疾病相关的致病性变异(Pathogenic)
B.人群频率1%的常见变异(Benign)
C.缺乏足够证据支持致病性或良性的变异
D.导致提前终止密码子的无义变异(Nonsense)
答案:C
解析:VUS(VariantofUncertainSignificance)指现有证据不足以判断致病性的变异;A是Pathogenic;B是Benign;D可能为致病性变异(需结合功能验证)。
基因注释工具ANNOVAR的主要功能是?
A.去除测序数据中的接头污染(AdapterTrimming)
B.对变异进行基因功能、数据库关联等信息标注
C.校正测序数据中的碱基错误(ErrorCorrection)
D.计算群体遗传多样性指标(如π值)
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可注释基因区域、数据库ID(如dbSNP)、功能影响(如错义突变)等;A是Trimmomatic功能;C是Pilon功能;D是PopGenome功能。
连锁不平衡(LD)通常用于分析?
A.单个基因的表达量差异
B.群体中标记间的非随机关联
C.肿瘤样本的克隆演化
D.线粒体DNA的母系遗传
答案:B
解析:LD指群体中两个标记(如SNP)同时遗传的频率高于随机预期,用于关联分析和单倍型推断;A是差异表达分析;C是肿瘤进化树分析;D是家系分析。
外显率(Penetrance)是指?
A.携带致病变异的个体表现出疾病表型的比例
B.变异在群体中的发生频率
C.基因在不同组织中的表达水平
D.染色体结构变异的长度
答案:A
解析:外显率是携带致病变异的个体实际发病的比例(如BRCA1变异的外显率约60-70%);B是等位基因频率(MAF);C是组织特异性表达;D是CNV长度。
以下哪种技术更适合检测拷贝数变异(CNV)?
A.全外显子测序(WES,平均深度100X)
B.低深度全基因组测序(WGS,平均深度10X)
C.Sanger测序(单基因验证)
D.实时荧光定量PCR(qPCR)
答案:D
解析:qPCR通过扩增特定区域定量检测CNV,是金标准之一;WES对CNV检测敏感性低(外显子区域覆盖不全);低深度WGS需专门算法(如CNVnator);Sanger无法检测CNV。
孟德尔遗传定律中的“分离定律”指?
A.同源染色体上的等位基因在配子形成时分离
B.非同源染色体上的非等位基因自由组合
C.显性性状在杂合子中表现
D.隐性性状需纯合子才表现
答案:A
解析:分离定律指配子形成时,同源染色体的等位基因分离(如Aa个体产生A和a配子);B是自由组合定律;C/D是显隐性表现规律。
宏基因组(Metagenomics)分析的核心目标是?
A.检测宿主基因组中的致病变异
B.研究环境中微生物群落的组成与功能
C.分析肿瘤样本的体细胞突变
D.验证单基因遗传病的致病机制
答案:B
解析:宏基因组直接测序环境样本(如粪便、土壤)中的所有微生物DNA,用于群落结构(16S/ITS)和功能基因(KEGG/COG)分析;A是临床基因组;C是肿瘤基因组;D是功能实验。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下属于变异致病性评估的关键证据来源有?()
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