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计算机辅助药物设计在中药现代化中的应用

从20世纪30年代开始，普筛就成为发现药物的主要方法，如抗疟药甲氟喹是从大量的合成化合物中筛选得到的。在20世纪40年代及50年代许多制药公司企图从土壤中通过随机筛选来寻找抗生素，结果发现了链霉素（streptomycin）及四环素两种主要的药物。但是这个方法显然需要耗费大量的人力和物力，而且盲目性较大，因此命中率低。但鉴于疾病病理的复杂性，至今人们还是不能完全预测和控制化合物的生物活性，故普筛仍然在药物发现上发挥着主要的作用，同时也是先导化合物发现的主要途径之一。从20世纪90年代开始，随着各种学科的发展，药物设计进入了一个新的阶段，即合理药物设计的阶段。合理药物设计取得重大突破的重要原因之一就是计算机辅助药物设计方法（CADD）的发展。多年来人们一直致力于阐明中药的物质基础和作用机制，但由于中药所含成分及其在人体中的吸收、代谢以及配伍等的复杂性，迄今仍难以提供有关中药疗效的完整的现代科学依据。阐明中药复方的化学成分以及多靶点效应机制，是突破中药研发现状的关键之一。运用传统中医药理论、结合现代科学技术进行中药研发，是我国当前中药产业的发展之路，也是新药研究的有效途径。计算机辅助药物设计(CADD)是连接传统中药和现代科学的重要纽带，其中分子对接(DOCK)、相似性搜索、药效团搜索、类药性筛选及毒性预测等技术，对中药复方研究均有很好的促进作用。

一、计算机辅助药物设计概述?

1、计算机辅助药物设计定义

计算机辅助药物设计（computeraideddrugdesign）是以\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank计算机化学为基础，通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank生物大分子之间的关系，设计和优化\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank先导化合物的方法。计算机辅助药物设计实际上就是通过模拟和计算受体与配体的这种相互作用，进行先导化合物的优化与设计。计算机辅助药物设计大致包括\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank活性位点\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank分析法、数据库搜寻、全新药物设计。受体是指生物体的细胞膜上或细胞内的一种具有特异性功能的生物大分子，与内源性激素、递质或外源性药物结合后，发生一定的特定功能，如开启细胞膜上的离子通道，或激活特殊的酶，从而导致特定的生理变化。能与受体产生特异性结合的生物活性物质称为\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank配体（ligand）。配体与\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank受体结合能产生与激素或神经递质等相似的生理活性作用的称为\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank激动剂；若与受体集合后阻碍了内源性物质与受体结合，从阻断了其产生生理作用的，则称为\t/item/%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA%E8%BE%85%E5%8A%A9%E8%8D%AF%E7%89%A9%E8%AE%BE%E8%AE%A1/_blank拮抗剂。计算机辅助药物设计实际上就是通过模拟和计算受体与配体的这种相互作用。进行先导化合物的优化与设计。

2、计算机辅助药物设计方法的分类?

计算机辅助药物设计方法大体上可以分为