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- 2026-01-26 发布于江西
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安徽医药AnhuiMedicalandPharmaceuticalJournal2023Aug,27(8)·1595·
引用本文:张玉俊,朱琳,赵璇,等.基于坏死性凋亡相关长链非编码RNA构建肝细胞癌预后模型及药物治疗反应
分析[J].安徽医药,2023,27(8):1595-1601.DOI:10.3969/j.issn.1009-6469.2023.08.023.
临床医学
基于坏死性凋亡相关长链非编码RNA构建肝细胞癌预后模型
及药物治疗反应分析
12112
张玉俊,朱琳,赵璇,地力亚尔·吾斯曼江,王岩
1
作者单位:新疆医科大学公共卫生学院,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830054;
2新疆医科大学附属肿瘤医院,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830011
通信作者:王岩,女,副教授,硕士生导师,研究方向为肿瘤流行病学,Email:xjwangyan2012163.com
基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2021D01C379);省部共建中亚高发病成因与防治
国家重点实验室开放课题项目(SKL-HIDCA-2020-ER3,SKL-HIDCA-2020-33)
摘要:目的使用坏死性凋亡相关长链非编码RNA(NRLs)构建肝细胞癌(HCC)预后模型并分析不同风险组间药物敏感性
差异,为HCC病人预后预测和临床个体化治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载HCC病人的
RNA测序数据和临床信息。采用共表达网络分析鉴定NRLs。使用单变量Cox回归和LASSO-Cox回归构建预后模型,并在测
试集和整个集合中进行验证。运用生存分析、受试者操作特征(ROC)曲线、临床病理分层相关性分析、多变量Cox回归、列线
图和校准曲线来评估预后模型。随后,采用基因集富集分析(GSEA)不同风险群体间生物过程和功能的差异。使用单样本基
因集富集分析(ssGSEA)来探讨不同风险群体与肿瘤免疫、浸润之间的关系,并采用Pearson相关分析HCC病人预后特征与免
疫检查点表达的相关性。最后,使用药物敏感性分析20种化疗药物在不同风险群体中的IC50值。结果构建了由4个NRLs
(ZFPM2-AS1、MKLN1-AS、LINC01116、AP003390.1)组成的风险评分(NRLsrisk-Score)预后特征,并根据风险评分中位值将病
人划分为高风险组和低风险组。生存分析表明,NRLs低风险组的总生存期(OS)显著高于高风险组;与临床病理特征相比,
NRLsrisk-Score具有更高的诊断效率,受试者操作特征曲线下面积(AUC)为0.74;临床病理变量分层生存分析表明,高风险组
病人OS显著低于低风险组;多变量Cox结果显示,分期(Stage)和NRLsrisk-Score可作为HCC病人的独立预后因子,结合临床
病理学特征和NRLsrisk-Score的列线图显示出较好的预测性能。GSEA分析表明,癌症相关通路主要在高风险组中富集。
ssGSEA结果显示,NRLs预测特征与HCC病人的免疫状态显著相关。免疫检查点分析结果显示,高风险组病人的免疫检查点
表达较高,表明可能受益于检查点阻滞剂免疫疗法的高风险组HCC病人中免疫功能更为活跃。化疗药物敏感性分析结果显
示,16种化疗药物的IC50值在高低风险组间存在差异。结论
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